稿件书写指南

学术文章或其他类型的出版物(如书籍章节)中发表的实验方案往往高度精简,难以复现。Bio-protocol 旨在填补这一空白,平台通过提供高质量、步骤详尽,经过同行评审,且被验证过的实验方案,从而保证其可重复性。我们的目标是这些实验方案可为新手提供足够的信息,使他们能在适当的建议或指导下可以成功地重复他人的实验。 我们欢迎投稿全新的实验方案,也接收那些在文献中描述不够详尽的经典方案。我们的同行评审过程注重实验方案的可行性与可重复性,而非新颖性。多数审稿人的修改建议主要集中在文字描述的清晰度和细节上,通常这些调整对作者来说相对容易完成。

作者可以点击此处Bio-protocol 网站提交稿件。有关稿件准备或提交的任何问题,请联系我们的责任编辑 Marisa Rosa (marisa.rosa@ed.bio-protocol.org)。同时,请参阅以下指南,它涵盖了Bio-protocol文章的主要组成部分的书写要求。

通用指南

作者必须遵循提供的稿件模板,并确保稿件中包含的所有信息都与该实验相关。Bio-protocol要求作者将稿件所有的文本和图表内容提交为一个单一的Microsoft Word文件,而视频则必须作为单独的文件提交。稿件应包含下面的“实验方案格式”部分所描述的章节。尽量避免使用缩写词,如使用请在首次出现时标注全称。点击此处查看Bio-protocol标准格式范例。

实验方案格式

作者必须遵循Bio-protocol的标准格式(如下)。有关每个部分的更多详细信息,请参见稿件模板

1. 实验方案标题

标题应体现实验方案的目标,描述准确简洁,以帮助潜在的研究者通过标题即可判断该方案是否为其所感兴趣的。鉴于研究者背景的广泛性,标题应易于不同领域的研究者理解。

2. 作者信息

请提供每位作者完整的隶属单位信息 (部门/学院、研究机构/大学、城市、国家)。

3. 摘要

摘要应简要介绍研究领域,概述实验方案,并突出该实验方案的目的及优势。

4. 关键特征

关键特征应总结代表该实验方案的重要特征。 此处不应简单地重复或浓缩摘要中的信息,相反,应强调能够让读者确定实验方案是否与他们的工作相关的特征。

5. 关键词

包括技术或方法相关的关键词,以帮助读者使用 Google 或其他搜索引擎轻松找到您的实验方案。 如果适用,也可直接使用您原始研究论文中的相关关键词。

6. 概述图

概述图可以是方法,程序的流程图或关键步骤的突显,但不应简单地复制稿件中的其他图片。在此处查看示例。请以图格式提供综述图。强烈建议包含此部分内容,但不是必需的。

7. 背景

此部分应当阐明改进实验方案的基本原理,并描述该实验方案在当前相关科学领域中所发挥的作用和意义。作者在此部分应当讨论总结已发表的相关实验方案,并总结本实验方案的优点,局限性和应用。

8. 材料和试剂

本章节应提供成功完成实验所需的所有生物材料、试剂、溶液(带配方)和实验室用品的详细列表,包括生产商及其目录号、如何获取或自研非市售产品的说明,以及重要试剂的储藏温度和保质期。对所使用的成分要准确,因为缺失细节信息可能会导致实验失败。作者应说明是否有任何材料受材料转移协议 (MTAs) 的约束,或任何数据是否受数据使用协议 (DUAs) 的约束。

9. 仪器设备

罗列实验中使用的仪器,需提供其生产商及相应的产品编号或型号。

10. 软件和数据

列出实验中使用的所有软件或数据,包括版本或发布日期。 此外,需提供非商业化资源的参考信息。

11. 实验步骤

为提高实验方案的可重复性,建议作者按时间顺序列出实验方案的所有步骤。实验方案应具体详实,包括所用材料和试剂的详细信息(例如,添加的体积、特定容器/试管和孵育时间)以及执行该步骤的条件(例如,温度、搅拌速度和设备设置); 避免使用模糊的术语,例如“几个”或“足够”。

在关键步骤,确保包括标签("Caution," "Pause point," or "Critical,",具体视情况而定)和注释(参见下面的实验注释和疑难排除),尤其是如果它会增加成功重复实验的可能性。根据需要,包括图像和视频以阐明关键步骤和代表性数据以阐明得到的结果。

有关文本、图形、表格和视频的详细的格式信息,请参见稿件模板

12. 数据分析

在此部分,作者应当提供数据处理和分析的方法,包括采用的统计检验、数据纳入或排除标准以及每个实验推荐的生物学或技术重复次数等详情。 应特别指出分析所需的特定技能(例如,使用 Linux、R 或其他数据分析软件的专业技能)。

如果已发表或预印本的研究文章中已经介绍了这些信息,作者应当在此部分总结分析方法并引用对应的文章。 请明确指出在哪里可以找到相关的信息(例如,补充信息或图的编号)。

13. 实验方案的验证

此部分旨在向读者确保该实验方案已经被验证过--能够产生可靠且可重复的结果。您可以提供以下信息来证明实验方案的可靠性和可重复性:

  • 直接提供验证数据
    请包含以下信息:独立重复实验次数、所用的统计检验方法、实验对照设置。若"数据分析"章节已包含相关的验证信息,可在此处简要引述。
  • 引用已发表的数据
    建议引用使用该方案的原始研究论文或预印本(如您已发表的科研工作)中的图表或补充材料作为佐证。

注:我们强烈推荐作者在本章节直接呈现关键验证数据,同时引用已发表的其他数据(特别是涉及的原始研究论文为非开放获取时)。

14. 注意事项和疑难问题排除

包括适用于整个实验方案而非完成个别步骤的注意事项。 例如,讨论该实验方案的局限性、它对其他实验系统或模式生物的适用性或可变性。

如果陈述可能发生的常见问题,请提供解决这些问题的方法。

15. 补充信息

请在本节中提供源数据或扩展数据,以及任何相关的支持材料。

16. 致谢

作者应具体指明每位作者的贡献;您可以使用我们的稿件模板中提供的示例,或者您认为合适的任何其他格式。另外,也应致谢支持其工作的经费来源渠道。若实验方案摘自或改编自先前发表的文章,请在此致谢先前的研究工作。如果您的原文章发表在我们的合作期刊上,请在这里引用原文章并添加其 DOI。

17. 利益冲突

责任作者应代表所有作者说明是否存在经济或非经济性利益冲突。在Bio-protocol,一种典型的经济性利益冲突是从试剂/设备生产商或其他供应商处获得资金或免费产品。有关更多信息,请参阅我们的利益冲突免责声明指南

18. 伦理声明

实验方案中以人或动物为研究对象的实验均需获得相关伦理委员会的许可,且作者须在稿件中声明。以人为研究对象的实验还需获得所研究对象的知情同意。此外,包括临床试验相关的实验方案应在稿件中明确声明试验注册机构名称和临床试验注册号。对于动物研究,我们建议遵循Animal Research: Reporting of In Vivo Experiments (ARRIVE)中建立的指南。有关更多信息,请参阅我们的出版伦理说明.

19. 参考文献

引用已接受、已发表或作为预印本发布的期刊文章。对于即将出版的已接受文章,请添加预期的出版日期。为实验方案中使用的所有数据集、程序代码和其他资源提供相关的引用信息。