Bio-101实验方案标准格式
鼓励 (但不要求) 作者采用Bio-101标准格式。Bio-101编辑团队将帮助作者对稿件格式进行编辑审校,确保所有稿件均符合Bio-101的标准格式。
在Bio-101上发表的实验方案包含以下12个部分:
  1. 实验方案标题 标题应体现实验方案目的,描述准确简洁,帮助读者通过标题即可判断该方案是否为其所感兴趣的实验方案。读者可能来自不同研究领域,因此在标题的选词上,要避免使用生僻的专业词汇。
  2. 作者信息 请提供每位作者详细的隶属单位信息 (部门/学院、研究机构/大学、城市、国家)。
  3. 摘要 (实验原理/实验目的) 简单概括实验的原理、目的、方法、结果或结论 (适用的下游实验)。
  4. 关键词 请提供3-5个关键词,关键词可以帮助读者通过Google等搜素引擎简单方便地检索到该实验方案。
  5. 材料和试剂 将该实验方案的读者想象为刚入门的新手。因此,这部分应当提供重复此实验方案所需的所有材料和试剂。并且,作者需要对关键产品说明生产商及其目录号。此外,强烈建议作者提供重要试剂的储藏温度和保质期。
  6. 仪器设备 书写要求同“材料和试剂”,罗列的仪器需提供其生产商及相应的产品编号或型号。
  7. 实验步骤 为提高试验方案的重复性,鼓励作者按时间顺序逐步列出实验方案的所有步骤。对于实验的关键步骤,作者应提供详细的有助于研究者成功重复该实验的经验技巧。书写实验步骤应使用主动语态(例:"Stock solutions and reaction mixtures were prepared under anaerobic conditions, using an MBraun glove box." should be described as "Prepare stock solutions and reaction mixtures under anaerobic conditions, using an MBraun glove box.")。
    在此部分,作者应提供:
    1. 关键步骤相关的图片和影像以帮助读者理解并提高实验方案重现性。
    2. 代表性数据示例以阐明得到的结果,我们鼓励作者提供原始数据。原始数据应是通过科学软件或工具 (如Excel, ImageJ) 获得的图片。避免使用图像软件 (如Illustrator, Photoshop) 处理过的图片。
  8. 数据分析 (可选) 在此部分,作者应当提供数据处理和分析的方法,包括采用的统计检验、数据纳入或排除标准以及生物学重复次数等详情。
  9. 实验注释 除“实验步骤”中本身包含的特定注释外 (参见上文),亦鼓励作者提供与实验方案相关的一般注释,例如:
    1. 作者实验操作过程中,实验的可重复性和变异性的说明;
    2. 提高实验重复性的其他注释、技术诀窍及注意事项。
  10. 配方 我们要求作者精确说明实验中使用的成分 (例如,缓冲液或培养基) 及实验条件,包括每种溶液的储存温度和保质期。注意,未完全遵循此部分中的小细节信息 (例如,试剂批号或用水类型) 常常会导致实验失败。如有任何材料须遵守材料转让协议,作者应在该章节备注说明。
  11. 致谢 作者应致谢支持其工作的经费来源渠道。若实验方案摘自或改编自先前发表的文章,请在此致谢先前的研究工作。作者应当在此部分声明任何利益冲突或竞争性利益。
  12. 参考文献 要求作者列出所有相关参考文献,但不要求作者必须按照Bio-101的格式编排参考文献,Bio-101编辑团队会完成此部分工作。Bio-101具体参考文献格式示例如下:
    程赛凤, 刘源, 陈香嵩, 赵毓. (2018). 免疫染色. Bio-101: e1010136. DOI: 10.21769/BioProtoc.1010136.
    Bindschedler, L. V., Dewdney, J., Blee, K. A., Stone, J. M., Asai, T., Plotnikov, J., Denoux, C., Hayes, T., Gerrish, C., Davies, D. R., Ausubel, F. M. and Bolwell, G. P. (2006). Peroxidase-dependent apoplastic oxidative burst in Arabidopsis required for pathogen resistance. Plant J 47(6): 851-863.
图、视频和表格
图:如果是文章原稿提交,Bio-101鼓励作者将图嵌入文本文件中 (PDF文件中包括的图除外)。实验方案接收后,Bio-101要求提供采用标准图像格式 (例如:TIFF、JPEG、PNG),最低分辨率为300 dpi的单个文件。一般情况下,图的宽度不应超过147毫米之间;图中所有文字字号为8-12号;单个面板标注格式:用“A,B,C…” (大写,粗体) 标注。整篇实验方案中,图中使用的字体应保持一致。
图像文件的处理不应导致原始图像误读。请参见 Rossner 和 Yamada (Journal of Cell Biology, 166:11) 中的“'What's in a picture? The temptation of image manipulation' (图片中应包含什么?图像处理的误区),了解不当的图像处理案例和有价值的操作指导。
视频:视频要清晰,普通的智能手机摄像头亦可录制足够清晰的视频。Bio-101要求采用标准视频格式 (例如,MOV,MPEG,AVI)。
表格:表格应按照在实验方案中出现的时间顺序编号,且应该放在文中首次引述之后。表格大小没有限制,Bio-101编辑团队会适当调整表格大小,以达到最佳的在线呈现效果。如果表格过大,则会建议作者将表格作为补充文件纳入。
图、视频和表格均应当有准确且相关的标题和图例。
命名法
要求使用标准的科学命名法。物种、基因、基因型和变种名使用斜体。应当查询相关物种的遗传数据库,以确保使用正确的名称。Bio-101鼓励作者使用物种的常用名常用名称 (在常用名称适用的情况下),首次使用时需在圆括号中提供拉丁文名称。作者应当确定其使用的命名法是否符合公认的业界标准。