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使用BEAST 2开展贝叶斯支端定年分析
Using BEAST 2 for Bayesian Tip Dating
Authors:  罗阿蓉张驰, 朱朝东 and date: 07/15/2021, view: 6093, Q&A: 0
... 研究背景生物类群的历史时间一直是生物学研究的基础和热点问题。但由于逝去历史的诸多不确定性,如何准确推断时间长期以来也面临各种挑战。 该方法将置换模型、演化速率、类群过程等纳入一个整体的统计学分析框架中,将化石信息纳入先验模型,从而估算类群的绝对历史时间。 第三,支端定年只需根据化石自身年代信息设置时间校准先验,无需对某节点的历史
使用MrBayes开展贝叶斯支端定年分析
Bayesian Tip Dating using MrBayes
Authors:  张驰罗阿蓉 and date: 07/23/2021, view: 3890, Q&A: 0
... 研究背景推断生物类群的系统发生关系和时间是分支系统学分析的基础。如何合理利用化石的形态和地质年代数据来完成此类推断一直是一个棘手的问题。 支端定年法把化石形态和年代数据整合在一次完整的计算过程中,能够尽可能充分地利用数据信息,同时考虑了树的拓扑结构、时间、演化速率以及化石年代的不确定性。 对于化石采样速率和生灭速率,可以假设是恒定的 (=diversity后面直接分号结束),也可以是随时间变化的 (=diversity后面按化石采样、