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GO/KEGG Enrichment Analysis on Gene Lists from Rice (
Oryza Sativa
)
水稻基因列表GO/KEGG富集分析
Author:
Yahui Li
date:
06/20/2022,
view:
2997,
Q&A:
1
... [摘要]在 RNA-seq 数据
分析
中,基因的功能富集
分析
已成为常规。许多富集
分析
软件
和网络应用程序已经出现。 ... 此文件在 clusterProfiler
软件
的通用扩充功能中提供 TERM2NAME 信息。文件格式如表 2 所示。 然而,当目标物种没有可用的注释文件时,研究人员可以使用eggNOG -mapper、
Likelihood Estimation of
Arabidopsis
Population Parameters with MAPGD
基于MAPGD的拟南芥群体参数的似然估计
Authors:
Yue Hao
Matthew S. Ackerman
,
Michael Lynch
and
date:
08/20/2023,
view:
275,
Q&A:
0
... 摘要:MAPGD (https://github.com/LynchLab/MAPGD) 是一种基于可能性的群体基因组数据
分析
软件
。 MAPGD
软件
主要设计用于
分析
浮游甲壳类水蚤种群(Lynch 等,2017;Maruki 等,2019;Ye 等,2019)。 ... 先前绘制的结果用于后续
分析
。 MAPGD:人口数据最大似然
分析
程序 (0.4.40)。
软件
和数据集
软件
1. SAMtools(Li 等人,2009;Li,2011;Danec