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其它脊椎动物
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原生动物
病毒
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Likelihood Estimation of
Arabidopsis
Population Parameters with MAPGD
基于MAPGD的拟南芥群体参数的似然估计
Authors:
Yue Hao
Matthew S. Ackerman
,
Michael Lynch
and
date:
08/20/2023,
view:
342,
Q&A:
0
... 摘要:MAPGD (https://github.com/LynchLab/MAPGD) 是一种基于可能性的群体基因组数据
分析
软件
。 MAPGD
软件
主要设计用于
分析
浮游甲壳类水蚤种群(Lynch 等,2017;Maruki 等,2019;Ye 等,2019)。 ... 先前绘制的结果用于后续
分析
。 MAPGD:人口数据最大似然
分析
程序 (0.4.40)。
软件
和数据集
软件
1. SAMtools(Li 等人,2009;Li,2011;Danec
GO/KEGG Enrichment Analysis on Gene Lists from Rice (
Oryza Sativa
)
水稻基因列表GO/KEGG富集分析
Author:
Yahui Li
date:
06/20/2022,
view:
3176,
Q&A:
1
... [摘要]在 RNA-seq 数据
分析
中,基因的功能富集
分析
已成为常规。许多富集
分析
软件
和网络应用程序已经出现。 ... 此文件在 clusterProfiler
软件
的通用扩充功能中提供 TERM2NAME 信息。文件格式如表 2 所示。 然而,当目标物种没有可用的注释文件时,研究人员可以使用eggNOG -mapper、
16S扩增子分析中常用软件及数据库应用现状
The Application Status of Commonly Used Software and Database in 16S Amplicon Analysis
Authors:
杨潇瀛
张浩林
,
韩莹莹
,
翁强
,
袁峥嵘
and
date:
04/23/2021,
view:
10061,
Q&A:
0
在众多
软件
之中,选取适合自身高效的
分析
软件
成为科研中不可或缺的一步。为此本文综述了在16S扩增子
分析
中常用的
软件
以及数据库,总结了其优缺点以供初学人员参考选择。
软件
和数据库 16S扩增子
分析
中常用
软件
1.1主流
分析
软件
(表1)1)mothur:2009年2月发布了mothur的第一个版本,目前被引用13,658余次,是由美国密歇根大学Patrick D. 该
软件
实现了从
分析
原始