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使用QIIME 2分析微生物组16S rRNA基因扩增子测序数据
Using QIIME 2 to Analysis Amplicon Sequencing of 16S rRNA Gene in Microbiome
Authors:  刘永鑫陈同, 钱旭波, 白洋 and date: 04/25/2021, view: 18048, Q&A: 3
... (可选) 训练分类器—指定V区分类器 如果扩增了指定的16S区域，还可以构建特异区域的分类器，可进一步提高分类精度。 GACTACHVGGGTATCTAATCC) 构建分类器。 如果你使用的研究非此引物，可以使用全长训练集，同时推荐使用实验中采用的引物训练特异的分类器应用于此，详见数据库部署。 Conda安装QIIME 2和训练分类器 安装Minicon
使用QIIME 2 2025.4分析微生物组16S rDNA基因和ITS扩增子测序数据
Using QIIME 2 2025.4 to Analyze Microbiome 16S rDNA Gene and ITS Amplicon Sequencing Data
Authors:  杨海飞曾美尹, 高云云, 陈同, 刘永鑫 and date: 08/01/2025, view: 2958, Q&A: 1
... 本文将介绍ITS工作流程的第一部分： （1）使用ITSxpres修剪ITS区域 （2）使用DADA2或Deblur调用序列变体 （3）训练QIIME 2分类器 （4）按分类学对序列进行分类 在本教程中， —指定V区分类器 使用与测试数据对应的V5（799F） - V7（1193R） 引物为例进行提取序列，耗时约6分钟。 如果你使用的研究非此引物，可以使用全长训练集，同时推荐使用实验中采用的引物训练特异的分类器应用于此，详见数据库部署。 在Lin