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谱系分析在群落生态学中的应用
The Application of Phylogenetic Methods in Community Ecology
Authors:  赵郁豪曾頔, 斯幸峰 and date: 10/28/2021, view: 13211, Q&A: 0
... 当研究只考虑连续性状变量并且物种数和性状数量较小时，读者也可以选择使用原始的距离矩阵 (欧几里得距离和Gower距离等) 进行功能多样性的计算。 本文先将功能性状转化为Gower相异距离矩阵 (Gower dissimilarity matrix) (Gower相异距离矩阵的优势在于可以处理分类变量的性状，并且可以为性状增加权重，但是本文并没有涉及上述两点 注意：在性状 (例如大于10个) 和物种数很多的情况下，基于距离矩阵计算功能
蚯蚓的野外采集、标本制作和群落分析流程
Protocols of Field Collection, Specimen Preparation and Community Analysis of Earthworms
Authors:  刘满强胥毛刚, 孙静, 王定一, 祁小旭, 蒋际宝, 胡锋 and date: 11/05/2022, view: 3246, Q&A: 0
... 最后，综合考虑生物不同模式水平和时空尺度，从多维度进行系统发育、功能性状或不同空间尺度的α、β和γ多样性计算。 蚯蚓功能性状 群落特征加权平均数指数 (Community-weighted mean trait values)：CWD = ΣPi×Xi Pi代表物种 i 的相对丰度，Xi 代表物种i的性状值，包括蚯蚓的蚓茧数 、结构、多样性和其他性状的变化，并通过筛选敏感种指示其所在的环境或生态系统的变化。 研究背景土壤生物多样性是维持生态系统结构、功能与稳定性
群落构建过程的定量指标——扩散-生态位连续体指数
Dispersal-niche Continuum Index: A Quantitative Metric of Community Assembly Processes
Authors:  孟凡凡Annika Vilmi, Corentin Gibert, 王建军 and date: 04/29/2021, view: 8813, Q&A: 0
... 这些因素可能包括：(1)研究区域的空间范围；(2)群落内部和群落之间样点的空间距离；(3)生物类群、分类水平和功能性状(如扩散能力、抗应激能力或摄食行为等)；(4)环境的异质性与同质性;
Identification of Expression QTL by QTLtools in a Rice Recombinant Inbred Line Population
水稻重组自交系群体中利用QTLtools鉴定QTL的表达
Authors:  Feng XiongHu Zhao, Weibo Xie and date: 06/20/2022, view: 913, Q&A: 0
... 它还提供了广泛的功能，包括检查序列数据的质量、量化基因表达、对个体进行分层以及将 QTL 与 GWAS结果和其他功能数据集成。 ...
Utilisation of Methylome Data to Identify Stably Unmethylated Regions in Plant Genomes
利用甲基组数据鉴定植物基因组中稳定的非甲基化区域
Authors:  Judith I. M. Eglitis-SextonLeroy M. Mangila, Haylie L. Andrews, Lee T. Hickey, Peter A. Crisp and date: 02/20/2024, view: 421, Q&A: 0
... 重要的是，以单碱基对分辨率识别甲基化的能力使我们能够具体了解甲基化（或缺乏甲基化）如何影响基因组的特定区域，包括可能对转录变化和性状表型变异很重要的调控区域。兴趣。 ... 通过玉米 CLE 基因的 CRISPR–Cas9 启动子编辑增强谷物产量相关性状。纳特。植物7(3)：287–294。 一些 300 bp 或更少的未甲基化区域可能具有重要的功能。然而，我们发现这些小的未甲基化区域中的大多数（而且有很多）缺乏功能性证据；例如，99.5% 的人没有可及的染色质 [ 3]