使用MrBayes开展贝叶斯支端定年分析
Bayesian Tip Dating using MrBayes
Authors: 张驰罗阿蓉 and
date: 07/23/2021,
view: 3859,
Q&A: 0
... MrBayes对生灭速率和化石采样速率重新参数化为:a净成种速率 (分异速率减去灭绝速率),b相对灭绝速率 (灭绝速率除以分异速率),c相对化石采样速率 (化石采样速率除以灭绝速率和化石采样速率之和)。 支端定年法把化石形态和年代数据整合在一次完整的计算过程中,能够尽可能充分地利用数据信息,同时考虑了树的拓扑结构、分异时间、演化速率以及化石年代的不确定性。 根据化石的地质年代的上下界, 设定为均匀分布 (uniform)。如果化石年代是确定的,