群体历史推断方法
The Methods for Inferring Population History
Authors: 刘俊锋季现超,
陈华 and
date: 04/21/2021,
view: 14882,
Q&A: 0
... 若单点突变发生在首次溯祖序列(i,j)上，则发射概率e(O|t,i,j)=ut，否则为1-ut，u为单个位点经过一代的突变率。 参数θ被定义为4N0 μ，μ表示基因组上单个位点 (site) 经过一代的突变率，其值需要预先设定；N0为常数，其值依赖于参数θ的估计值。 7 x 10-10，且一代的时间设为3个月；黑腹果蝇的样本数为197，单个位点经过一代的突变率设为3 x 10-9，且一代的时间设为1个月。 Li和Durbin用PSMC模型分析东亚、欧洲和非洲三个群体的历史，其单