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随机宏基因组测序数据质量控制和去宿主的分析流程和常见问题
Analysis Pipeline and Frequently Asked Questions of Quality Control and Host Removal in Shotgun Metagenomic Sequencing
Authors:  刘永鑫刘芳, 陈同, 白洋 and date: 12/10/2020, view: 9992, Q&A: 0
KneadData流程实现数据质量控制和宿主。 MultiQC汇总质量控制、宿主和最终序列的情况。A. 单个样本质控和宿主,可逐个或结合for循环处理每个样本。 KneadData流程质量控制和宿主结果统计注:Sample为样本名,raw 1/2是双端测序的数据量,trimmed 1/2是经Trimmomatic质量控制后仍成对的序列,final 1/2是指经过质量控制和宿主仍成对的序列