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基于二代转录组数据的可变剪接和可变多聚腺苷酸化分析
Analysis of Alternative Splicing and Alternative Polyadenylation Patterns Based on Transcriptome Data by Next Generation Sequencing
Authors:  黄雪娜战爱斌 and date: 09/23/2021, view: 5345, Q&A: 0
全基因组水平可变剪接事件/基因的鉴定和定量是研究可变剪接调控机制的前提，高通量测序技术为可变剪接相关研究提供了良好的技术平台并积累了大量的数据基础。 由于二代测序短读长在组装上的劣势造成转录本组装的不准确性，本文选取基于剪接位点的rMATS软件和APAtrap软件分别就其在可变剪接和可变多聚腺苷酸化研究中的常规分析流程进行阐述。 因此，基于大量积累的二代转录组测序数据，选择合适的分析工具进行可变
An Analysis Pipeline for Identification of RNA Modification, Alternative Splicing and Polyadenylation Using Third Generation Sequencing
使用第三代测序鉴定 RNA 修饰、可变剪接和多聚腺苷酸化的分析流程
Authors:  Yuxiang LiufuXuqing Liu, Lin Wu, Hangxiao Zhang, Yubang Gao, Lianfeng Gu and date: 06/05/2022, view: 1370, Q&A: 0
... 关键词： 纳米孔直接 RNA 测序，PacBio Iso-Seq，RNA 修饰， N 6 -甲基腺苷，选择性剪接，选择性多聚腺苷酸化图文摘要：基于第三代测序技术的RNA修饰、选择性剪接和选择性多聚腺苷酸化鉴定流程图 ... 茶花花青素生物合成的可变剪接调控。由 PacBio Iso-Seq 推出的 assamica。 G3（贝塞斯达）