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基于二代转录组数据的可变剪接和可变多聚腺苷酸化分析
Analysis of Alternative Splicing and Alternative Polyadenylation Patterns Based on Transcriptome Data by Next Generation Sequencing
Authors:  黄雪娜战爱斌 and date: 09/23/2021, view: 5345, Q&A: 0
同时，可变多聚腺苷酸化作为一种重要的转录后调控机制，通过选择前体mRNA 3’末端不同的多聚腺苷酸化位点 (PAS)，产生具有不同3’UTR长度的转录本，进而影响转录本的稳定性、表达量和翻译效率 (Pereira-Castro 三、APAtrap软件进行差异可变多聚腺苷酸化分析近年来研究发现基因在转录过程中存在poly(A) 位点的选择，造成具有不同长度3'UTR序列的转录异构体。 由于二代测序短读长在组装上的劣势造成转录本组装的不准确性，本文选取基于剪接位点的rMATS软件和APAtrap软件分
野生动物微生物组数据平台构建的技术方法和实践挑战
Technical Frameworks and Practical Challenges in Developing Wildlife Microbiome Databases
Authors:  王恺毅杨蕊菁, 李雨霏, 赵李頔涵, 闫利平, 王海燕, 高云云 and date: 02/05/2026, view: 97, Q&A: 0
... Animal-APAdb [21] 专注于动物RNA-seq数据的可变多聚腺苷酸化调控信息，从宿主转录调控的角度补充了组学数据，但并非直接的微生物组数据库，需要与宏基因组或宏转录组数据平台结合才能发挥综合作用 平台运行环境基于CentOS 7.6，并通过Docker容器化方式管理分析流程与依赖软件，从而实现可扩展、可维护的数据库服务。表5. 这类设计解决了科学可视化工具常见的学习曲线陡峭、可定制性不足的问题。 本文关注的核心在于归纳具有可迁移性的技术思路与实现经验，而非呈现具体的