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Visualizing, Binning, and Refining of Metagenome-assembled Genomes (MAGs) with Anvi’o
利用Anvi'o对元基因组组装的基因组(MAG)进行可视化、分档和提炼
Authors:  Soumyadev SarkarTanner Richie, Sonny T. M. Lee and date: 05/20/2023, view: 670, Q&A: 0
... 在此关头,需要一个简单的基于可视化界面的工作流程,能够胜任分析如此庞大的宏基因组数据集。 Anvi'o
ImageGP在微生物组可视化中的应用
Visualization of Microbiome Data Using ImageGP
Authors:  陈同刘永鑫 and date: 04/23/2021, view: 3964, Q&A: 0
并可通过箱线图进行可视化和使用方差分析等检验alpha多样性指数的分布在组间是否有显著差异。 Alpha多样性数据表格展示2.3通常在可视化或比较样本组之间的Alpha 多样性时,还需要提供metadata 文件,指定样本的分组信息 (表1)。 ImageGP当前支持的数据可视化类型和描述每个工具都提供了Demo示例,并用轮播图展示了输入数据、输入参数和所能获得的图的样式 (图13)。图13. ImageGP支持绘制的部分图形和分析功能微生物组样品内Alpha 多样性结果的可视化与统计检验2.1Alpha