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Visualizing, Binning, and Refining of Metagenome-assembled Genomes (MAGs) with Anvi’o
利用Anvi'o对元基因组组装的基因组(MAG)进行可视化、分档和提炼
Authors:
Soumyadev Sarkar
Tanner Richie
,
Sonny T. M. Lee
and
date:
05/20/2023,
view:
670,
Q&A:
0
... 在此关头,需要一个简单的基于
可视化
界面的工作流程,能够胜任分析如此庞大的宏基因组数据集。 Anvi'o
ImageGP在微生物组可视化中的应用
Visualization of Microbiome Data Using ImageGP
Authors:
陈同
刘永鑫
and
date:
04/23/2021,
view:
3964,
Q&A:
0
并可通过箱线图进行
可视化
和使用方差分析等检验alpha多样性指数的分布在组间是否有显著差异。 Alpha多样性数据表格展示2.3通常在
可视化
或比较样本组之间的Alpha 多样性时,还需要提供metadata 文件,指定样本的分组信息 (表1)。 ImageGP当前支持的数据
可视化
类型和描述每个工具都提供了Demo示例,并用轮播图展示了输入数据、输入参数和所能获得的图的样式 (图13)。图13. ImageGP支持绘制的部分图形和分析功能微生物组样品内Alpha 多样性结果的
可视化
与统计检验2.1Alpha