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DNA稳定同位素示踪与宏基因组单菌草图组装联用技术
DNA-Stable Isotope Probing and Metagenomics Binning
Authors:
徐锐
陶婉
,
黄端仪
,
苏平舟
,
孙晓旭
,
张苗苗
,
孙蔚旻
and
date:
04/12/2021,
view:
4587,
Q&A:
0
基本原理稳定
同位素
示
踪
原理 在碳同化培养体系中添加含13C的标记物与微生物共培养。该过程中微生物如果可以利用标记物进行同化作用,则可将13C合并至自身DNA,从而完成对目标功能菌群的“标记”。 标记样品的选择与高通量测序图8所
示
:重点选取每个离心样品的各峰尖层 (F10)、及左右两层 (F9+F11) 进行测序可减少测序成本。 宏基因组Bins的物种注释与功能基因注释结果图9所
示
:重点针对“重层”DNA样品进行宏基因组测序,并采用MetaWRAP分箱组装后一共获得了5个高质量的基因组草图 (Bins)。