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Applying AnchorWave to Address Plant Genome Alignment
应用 AnchorWave 解决植物基因组比对问题
Authors:  Shuai WangQinlin Xu, Baoxing Song and date: 10/05/2023, view: 724, Q&A: 0
... 摘要：随着长读长测序技术的大规模发展，越来越复杂的基因组正在被组装。 基因组比对是大多数基因组学研究的重要步骤。
Visualizing, Binning, and Refining of Metagenome-assembled Genomes (MAGs) with Anvi’o
利用Anvi'o对元基因组组装的基因组（MAG）进行可视化、分档和提炼
Authors:  Soumyadev SarkarTanner Richie, Sonny T. M. Lee and date: 05/20/2023, view: 679, Q&A: 0
... 宏基因组分箱是使用起源生物对宏基因组序列进行分组的过程。 然后，我们使用数据集可视化并执行宏基因组组装基因组 (MAG) 的手动分箱和细化。 Anvi'o
Metagenomic Protocol (From Quality Control to Mapping) for Metagenome-assembled Genomes Using Anvi’o
基于Anvi'o宏基因组组装的宏基因组方案（从质量控制到绘图）
Authors:  Soumyadev SarkarTanner Richie, Sonny T. M. Lee and date: 05/20/2023, view: 345, Q&A: 0
... Anvi'o 能够分析一系列多组学数据，包括宏基因组学、基因组学、泛基因组学、系统基因组学、元泛基因组学、元转录组学和微生物种群遗传学。 ... 评估在 Illumina HiSeq
Maize Genome Assembly with PacBio Reads
利用PacBio Reads组装玉米基因组
Authors:  Ying HuMarcio F. R. Resende Jr. and date: 07/05/2022, view: 997, Q&A: 0
... 该方法生成长度为数十千碱基的读取，使其适用于提高基因组连续性，缩小当前参考基因组中的差距，并识别基因组之间的结构变异。 ... 基因组组装为了进行玉米基因组组装，我们提供了用于甜玉米基因组组装的Canu版本 1.8 的说明（Hu et al .,
Isolation of Genomic DNA from Chlamydomonas reinhardtii
莱茵衣藻基因组DNA的分离
Author:  Tyler M Wittkoppdate: 05/05/2018, view: 13711, Q&A: 0
... 随着核，叶绿体和线粒体基因组的测序，衣藻也是遗传学和基因组学研究的优秀生物。 该协议描述了使用标准酚：氯仿提取方法然后乙醇沉淀从衣藻（Chlamydomonas）中分离基因组DNA。 ... 注意：此时，基因组DNA沉淀不会进入溶液。