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Applying AnchorWave to Address Plant Genome Alignment
应用 AnchorWave 解决植物基因组比对问题
Authors:
Shuai Wang
Qinlin Xu
,
Baoxing Song
and
date:
10/05/2023,
view:
811,
Q&A:
0
... 摘要:随着长读长测序技术的大规模发展,越来越复杂的
基因组
正在被组装。
基因组
比对
是大多数
基因组
学研究的重要步骤。 灵敏而准确地
比对
复杂的
基因组
对于从这些
基因组
中获取信息至关重要。
GATK Variant Discovery Pipeline
GATK变异发现分析流程
Authors:
Cheng He
Sanzhen Liu
and
date:
09/20/2024,
view:
443,
Q&A:
0
... 基于参考的 SNP 调用是根据
比对
来识别测序读数和参考之间的 DNA 多态性的过程 [3]。已经开发了用于 SNP 调用的算法和软件包。 ... /workflow/2_bwa_align.sh步骤 3:SAM 过滤和压缩 在此步骤中,根据参考
基因组
上的
比对
坐标对原始
比对
(SAM 格式)进行过滤和排序。