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野生动物微生物组数据平台构建的技术方法和实践挑战
Technical Frameworks and Practical Challenges in Developing Wildlife Microbiome Databases
Authors:  王恺毅杨蕊菁, 李雨霏, 赵李頔涵, 闫利平, 王海燕, 高云云 and date: 02/05/2026, view: 222, Q&A: 0
... 数据规模的持续扩张将推动数据库从单一组多组、跨尺度数据的整合发展。 这些数据类型涵盖了扩增子测序、宏基因组测序、宏转录组、代谢组以及多组整合数据,既包含基因序列、功能注释等基础信息,也反映了从个体到群落结构的多层次特征 [2]。 Reactome [33] 则通过网络化数据模型描述分子转化过程,将基因、蛋白质、代谢物及其相互作用组织为可查询、可视化的有向网络,方便对多组数据进行整合分析,并辅助发现新
群落构建过程的定量指标——扩散-生态位连续体指数
Dispersal-niche Continuum Index: A Quantitative Metric of Community Assembly Processes
Authors:  孟凡凡Annika Vilmi, Corentin Gibert, 王建军 and date: 04/29/2021, view: 8873, Q&A: 0
因此,越来越多的研究开始整合生态位理论和中性理论,并探究群落构建中确定性过程和随机性过程的相对贡献大小。 前言 生物群落的构建机制是群落生态和生物地理学中的热点问题。在全球变化背景下,如何正确地回答这一问题对于生物群落的管理和保护有着重要的意义。 为了量化不同生态过程的相对重要性,Stegen et al.(2013)基于Chase et al.(2011)开发的分类Raup-Crick指数RCbray,结合系统发育βNTI指数,建立了一种基于群落水平的零模型 3.3DNCI指数的计算 使用R包DNCImper中的DNC
Identification of Expression QTL by QTLtools in a Rice Recombinant Inbred Line Population
水稻重组自交系群体中利用QTLtools鉴定QTL的表达
Authors:  Feng XiongHu Zhao, Weibo Xie and date: 06/20/2022, view: 935, Q&A: 0
人类基因组。基因型-组织表达 (GTEx) 初步分析:人类多组织基因调控。 科学348(6235):648-660。 eQTL区域中的基因以整合的方式进行整合,有助于进一步实验验证调控关系(Tang等,2021) 。 基因流行病 32 (3):227-234。 生物信息32(10):1479-1485。8.沙巴林,AA(2012 年)。矩阵 eQTL:通过大型矩阵运算进行超快速 eQTL 分析。 生物信息28(10):1353-1358。