宿主污染的搜索结果

  • Peer-reviewed
  • Preprint
  • Extracted from published research articles
  • 生物化学
  • 生物信息学与计算生物学
  • 生物物理学
  • 癌症生物学
  • 细胞生物学
  • 发育生物学
  • 免疫学
  • 微生物学
  • 分子生物学
  • 神经科学
  • 植物科学
  • 干细胞
  • 系统生物学
  • 相关性
  • 日期
  • 浏览量
随机宏基因组测序数据质量控制和去宿主的分析流程和常见问题
Analysis Pipeline and Frequently Asked Questions of Quality Control and Host Removal in Shotgun Metagenomic Sequencing
Authors:  刘永鑫刘芳, 陈同, 白洋 and date: 12/10/2020, view: 10203, Q&A: 0
综合统计(General Statistics),%Aligned是指比对至宿主基因组的比例,即宿主污染所占比例,%Dropped为低质量或建库污染的比例。B. 结果不仅有序列基本信息统计,还包括质控去除比例(%Dropped)和宿主污染比例(%Aligned)的信息(图4A)。其中质控部分还采用堆叠柱状图展示质控后各部分的百分比(图4B)。 比对宿主后各部分序列的比例。蓝色为比对至宿主基因组且有唯一位置,橙色为比对至宿主中有多个位置