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Applying AnchorWave to Address Plant Genome Alignment
应用 AnchorWave 解决植物基因组比对问题
Authors:  Shuai WangQinlin Xu, Baoxing Song and date: 10/05/2023, view: 714, Q&A: 0
... 该软件首先识别具有保守锚点的共线区域，然后对每个锚点和锚点间区域执行碱基对解析的全局序列比对。 AnchorWave为碱基对解析的植物基因组比对提供了显着的改进。 ... 序列比对/图谱格式和 SAM 工具。 生物信息学25(16): 2078 – 2079。李红（2018）。 Minimap2：核苷酸序列的成对比对。 生物信息学34(18): 3094 –
Method for Analysing Protein Structure of SARS-COV-2 M Protein for Possible Clues Regarding Virion Stability, Longevity and Transmission
通过分析SARS-COV-2 M蛋白结构为确定病毒稳定性、存活时间和传播提供可能线索
Authors:  Saam HasanMuhammad Maqsud Hossain and date: 05/05/2022, view: 657, Q&A: 0
... 我们使用NCBI BLAST在两种病毒的M蛋白之间进行了蛋白质序列比对，并使用SWISS-MODEL对随后的3D结构进行了预测。之后，我们分析了特定的氨基酸变化以及它们如何解释两者之间的功能差异。 ... 序列比对Refseq M蛋白氨基酸序列获自NCBI蛋白。SARS-CoV的-2和SARS- CoV的M蛋白序列使用对准的Blastp