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Transformation, Normalization, and Batch Effect Removal
转换、归一化和批量效应去除
Authors:  Lei YuHan Qu, Qiong Jia, Xuesong Wang, Zhenyu Jia and date: 07/20/2022, view: 7133, Q&A: 0
... 标准归一化方法包括文库大小归一化和基因长度归一化。文库大小标准化侧重于通过单个样本特定因子缩放每个样本中的原始读取计数，从而反映其文库大小，从而使文库大小具有可比性。 ... 常用的归一化方法包括文库大小归一化和基因长度归一化（ Abbas-Aghababazadeh and Li, 2018 ） 。文库大小归一化将原始计数矩阵的每一列除以其他样本估计的归一化因子。
基于成像的细胞计数方法---Seahorse细胞能量代谢分析 系统数据归一化方法
Image-based Cell Number Analysis---Data Normalization Method in Seahorse Cell Metabolic Analysis
Authors:  赵曚田维新, 韩帅, 郭蕴郦, 陈铭 and date: 11/09/2021, view: 3653, Q&A: 0
经过辅助贴壁处理的悬浮细胞也可用这种方法进行归一化处理，但悬浮细胞如果粘连，将无法准确分辨细胞个数，分析出的细胞数将会不准确，要求均匀独立铺在细胞板底。 从图11可以看出，利用此方法进行数据归一化处理后（J Cell Mol Med），成功消除了孔间细胞数不同导致的数据差异，可反应细胞能量代谢的实际差异。图9. 利用如下公式对各孔数据进行细胞数归一化处理，如图9输入活细胞数目：Normalized OCR = OCR / (Hoechst 33342阳性细胞数 – PI 阳性细胞数)* 比例因子。 A类细胞和B类细胞经过细胞计数归一化