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口腔微生物组研究主要取样部位及方法
Major Sampling Sites and Methods of Oral Microbiome
Authors:  卢洪叶张翼飞, 张倩, 陈智滨, 陈峰 and date: 04/27/2021, view: 4063, Q&A: 0
（单个位点的样本可用以研究该位点的微生物组；多个指数牙的集合样本可用以研究患者水平的微生物组；具有相同临床特征的多个位点的集合样本可用以研究该临床特征所对应的微生物组）样本贮存：短期（1个月）内可存放于 （单个位点的样本可用以研究该位点的微生物组；多个指数牙的集合样本可用以研究患者水平的微生物组；具有相同临床特征的多个位点的集合样本可用以研究该临床特征所对应的微生物组）样本处理：同
全球微生物组整体结构和功能的搜索
Taxonomic and Functional Search of Global Microbiomes on the Whole-Microbiome Level
Authors:  赵丰洋李坚, 荆功超, 苏晓泉 and date: 04/29/2021, view: 3383, Q&A: 0
微生物组测序序列数据的预处理，根据测序序列类型和搜索模式，处理软件详见表1。 实验步骤微生物组测序序列数据预处理 MSE 2可以从群落物种组成和功能组成两个角度进行搜索，兼容16S rRNA基因扩增子 (以下简称16S扩增子) 测序数据和鸟枪法宏基因组测序 (Shotgun Metagenomic 微生物组样本需以OTU (Operational Taxonomy Unit)、物种 (species) 或KO (KEGG Orthology)
微生物组的定量宏基因组学和定量宏转录组学方法
Quantitative Metagenomics and Metatranscriptomics Methods of Microbiome
Authors:  黄昕瑜张璐, 袁凌, 鞠峰 and date: 04/13/2021, view: 6166, Q&A: 1
内标序列设计的基本原则和注意事项 本流程通过人工合成的DNA和RNA内标物投加来实现微生物群落的定量宏基因组学和定量宏转录组学分析，内标序列在设计时需要满足以下几个条件： 1）该序列为受测环境样品或自然环境中不存在的序列 Precisa XJ220A SCS）Nanodrop OneC（Thermo）涡旋混合器（杭州奥盛 MTV-1）实验步骤内标序列和PCR引物的设计与合成 本流程通过人工合成的DNA和RNA内标物投加来实现微生物群落的定量宏基因组学和定量宏转录组学分析 4.
对虾养殖系统微生物组样品的采集与制备
Collection and Preparation of Microbiota Samples in Shrimp Culture System
Authors:  董鹏生黄雷, 王艳婷, 郭海朋, 张德民 and date: 02/25/2021, view: 3394, Q&A: 0
对虾消化道微生物组DNA提取。 取0.2 g研磨后样品，使用QIAamp? Fast DNA Stool Mini Kit试剂盒提取对虾幼体微生物组DNA（具体操作步骤见附录1）。育苗水体微生物组DNA提取。 由于对虾幼体较小，很难从虾体中分离完整的肠道，因此采集整只虾体测定微生物组。 每瓶水样收集3张富集微生物的滤膜。样品保存。用无菌镊子将富集微生物的滤膜装入5 ml EP管，迅速置于液氮中，之后转至-80°C超低