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基于微生物成分数据的差异zOTU分析流程
Workflow for Discriminative zOTU Analysis Based on Compositional Data
Authors:
焦金真
张小丽
,
王敏
,
谭支良
and
date:
04/27/2021,
view:
5373,
Q&A:
0
成分
数据
的下游分析是基于通过CLR计算的Aitchison距离,之后进行PCA (Principal Component Analysis) 降维,这可以最大程度地保证
成分
数据
的降维是通过
数据
集中变异程度最大的 基于
成分
数据
的Normalization是通过centered log-ratio (CLR) 将测序
数据
转化为比例
数据
(Thorsen et al., 2016),极大地降低了下游分析受测序深度的影响程度 微生物
数据