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混合分子标记扩增子高通量测序方案
A Mixed Molecular Marker Amplicon Sequencing Scheme Based on High Throughput Sequencing Platform
Authors:  李佳璇张圆, 梁丹, 张鹏 and date: 01/25/2021, view: 5217, Q&A: 0
(目标扩增子的选择可参考研究背景中列出的适用于不同生物类群的分子标记工具箱)，随后再按照: 扩增子混合，DNA片段化，样本特异性标签连接，多样本混合和片段筛选，文库构建和高通量测序共五个步骤，实现混合分子标记扩增子的高通量测序 二、 扩增子混合 (参考图1步骤1) 为了简化实验操作流程，降低实验劳动强度，本方法并没有对每个PCR产物进行单独纯化，而是直接等体积混合同一物种不同的PCR产物，对于无可见条带或有非特异性扩增条带的PCR partitionfinder/releases/tag
使用QIIME 2分析微生物组16S rRNA基因扩增子测序数据
Using QIIME 2 to Analysis Amplicon Sequencing of 16S rRNA Gene in Microbiome
Authors:  刘永鑫陈同, 钱旭波, 白洋 and date: 04/25/2021, view: 17880, Q&A: 3
生成特征表和代表序列 DADA2是基于R语言编写的扩增子分析流程，可以实现扩增子序列去除测序噪音、错误和嵌合体，并挑选扩增序列变体 (amplicon sequence variant, ASV) 和生成特征表 宏基因组公众号团队建立了微生物组领域的扩增子和宏基因组常用软件和数据库的国内备份站点，方便同行下载和使用。站点1. 扩增子差异分析也经常在属水平进行，结果有名称更利于与专业知识结合进行生物学意义的讨论和规律发现。下面演示按属水平合并，并采用ancom统计。 对于混池测序末拆分样本
使用QIIME 2 2025.4分析微生物组16S rDNA基因和ITS扩增子测序数据
Using QIIME 2 2025.4 to Analyze Microbiome 16S rDNA Gene and ITS Amplicon Sequencing Data
Authors:  杨海飞曾美尹, 高云云, 陈同, 刘永鑫 and date: 08/01/2025, view: 2687, Q&A: 1
本研究旨在提供一套基于 QIIME 2 2025.4 版本的标准化实验方案，针对微生物组 16S rDNA 基因扩增子测序数据的处理与分析。 ，可以实现扩增子序列去除测序噪音、错误和嵌合体，并挑选扩增序列变体（amplicon sequence variant, ASV）和生成特征表（feature table）的功能[12]。 对于混池测序末拆分样本的原始数据，需要使用QIIME[9]中的脚本进行拆分，或要求测序服务商提供拆分后的单样本fastq格式测序文件。 通过以
Marker Genes (16S and ITS) Protocol for Plant Microbiome Analyses
植物微生物组分析的标记基因（16S 和 ITS）实验方法
Author:  Geoff Zahndate: 04/20/2022, view: 1517, Q&A: 0
... 通常，这些数据是通过对 16S（用于细菌）或 ITS（用于真菌）扩增子进行测序而获得的，这些扩增子已使用特定样本的条形码进行标记。 ... 输入数据是解复用的 fastq从测序的细菌 16S