扩增测序的搜索结果

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土壤线虫群落DNA提取、扩增及高通量测序
DNA Extraction, Amplification and High-throughput Sequencing of Soil Nematode Community
Authors:  杜晓芳梁文举, 李琪 and date: 06/17/2021, view: 6537, Q&A: 0
7)提取的线虫DNA储存在-80 °C冰箱用于后续的PCR扩增和测序。图1. 土壤线虫DNA提取流程示意图三、线虫群落的扩增测序 使用引物NF1-F/18Sr2b-R (Porazinska et al., 2009) 对线虫18S rDNA V4区进行扩增。 线虫高通量测序数据的处理可根据需求灵活分析，也可使用Usearch软件对原始测序序列进行质控，聚类，生成OTU表。 根据Illumina MiSeq平台 (Illumina, San Diego, USA) 标准
混合分子标记扩增子高通量测序方案
A Mixed Molecular Marker Amplicon Sequencing Scheme Based on High Throughput Sequencing Platform
Authors:  李佳璇张圆, 梁丹, 张鹏 and date: 01/25/2021, view: 5310, Q&A: 0
，实现混合分子标记扩增子的高通量测序，其工作流程图如图1所示。 混合PCR产物高通量测序方案的实验流程图 一、 对所选分子标记进行PCR扩增 在大规模扩增分子标记之前，建议开展一个预实验，随机挑选2-3个样本和5-10种分子标记分别进行PCR扩增，目的是确保PCR反应体系 ，获得大量的扩增子 (目标扩增子的选择可参考研究背景中列出的适用于不同生物类群的分子标记工具箱)，随后再按照: 扩增子混合，DNA片段化，样本特异性标签连接，多样本
使用QIIME 2分析微生物组16S rRNA基因扩增子测序数据
Using QIIME 2 to Analysis Amplicon Sequencing of 16S rRNA Gene in Microbiome
Authors:  刘永鑫陈同, 钱旭波, 白洋 and date: 04/25/2021, view: 18154, Q&A: 3
生成特征表和代表序列 DADA2是基于R语言编写的扩增子分析流程，可以实现扩增子序列去除测序噪音、错误和嵌合体，并挑选扩增序列变体 (amplicon sequence variant, ASV) 和生成特征表 (可选) 训练分类器—指定V区分类器 如果扩增了指定的16S区域，还可以构建特异区域的分类器，可进一步提高分类精度。 对于混池测序末拆分样本的原始数据，需要使用QIIME (Caporaso et al., 2010) 中的脚本进行拆分，或要求测序服务商提供拆分
使用QIIME 2 2025.4分析微生物组16S rDNA基因和ITS扩增子测序数据
Using QIIME 2 2025.4 to Analyze Microbiome 16S rDNA Gene and ITS Amplicon Sequencing Data
Authors:  杨海飞曾美尹, 高云云, 陈同, 刘永鑫 and date: 08/01/2025, view: 3177, Q&A: 1
，可以实现扩增子序列去除测序噪音、错误和嵌合体，并挑选扩增序列变体（amplicon sequence variant, ASV）和生成特征表（feature table）的功能[12]。 本研究旨在提供一套基于 QIIME 2 2025.4 版本的标准化实验方案，针对微生物组 16S rDNA 基因扩增子测序数据的处理与分析。 对于混池测序末拆分样本的原始数据，需要使用QIIME[9]中的脚本进行拆分，或要求测序服务商提供拆分后的单样本fastq格式测序