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基于混合PCR产物制备捕获探针的基因组捕获方法
Genome Sequence Capture Based on Pooled PCR-generated Baits
Authors:
张 圆
梁 丹
,
张 鹏
and
date:
03/10/2021,
view:
3974,
Q&A:
0
文库可以批量构建好后-20 °C保存,待探针和文库都准备好后一起进行
杂交
捕获
。
杂交
捕获
推荐将4个带有不同特异性标签的文库混合在一起,进行
杂交
捕获
。 最近,又有学者提出了一种新的策略:根据系统发育关系将所研究类群分为多个进化支系,为每一支系设计一套探针,再将多套探针混合起来进行
杂交
捕获
。这种策略能够缩小了探针与被
捕获
样本间的遗传距离,提高
捕获
效率。 另一种策略是直接针对保守度较低的外显子区域设计探针,但使用较为宽松的
AFLP基因组捕获技术: 一种通用的低阶元的系统发育分析方法
AFLP Genome Capture Technique: A General Method for Shallow Scale Phylogenetic Analysis
Authors:
李佳璇
梁丹
,
张鹏
and
date:
02/10/2021,
view:
3340,
Q&A:
0
为了从
捕获
样本的基因组文库中
杂交
捕获
到与探针同源的基因组区域,特别是从亲缘关系较远的样本中,通常需要根据
捕获
样本与探针制备样本之间的序列相似度,对
杂交
体系中的盐离子浓度,
杂交
反应温度等条件进行优化和调整 三、
杂交
捕获
(总耗时:约41 h) 在系统发育研究中,
捕获
样本往往与探针制备样本不同。 洗涤 (耗时:约1.5 h) 该步骤的主要目的是利用不同盐离子浓度的缓冲液对
杂交
产物进行洗涤,以去除非目标
捕获
超级保守元件 (UCE) 的捕获及分析流程
Protocols of UCE Capture and Data Analysis
Authors:
梁雅迪
赖佳星
,
高晓荣
,
王耀卓
,
张俊霞
and
date:
06/11/2021,
view:
6211,
Q&A:
0
UCE的
杂交
捕获
主要包含以下几个主要步骤:DNA提取、DNA片段化、文库构建、
杂交
捕获
富集和测序。 四、
杂交
捕获
富集UCE
杂交
捕获
富集使用myBaits试剂盒 (Arbor Biosciences Corp.)。 第一部分 UCE探针设计探针为生物合成的核苷酸序列,用于
捕获
样品DNA中的目标片段,是基于
杂交
富集原理的系统发育基因组学研究的关键。 一般来讲,较高质量和总量 (> 200 ng) 的DNA可提高后续
细菌转录组分析样品制备方法
Sample Preparation for Bacterial Transcriptome Analysis
Authors:
武迎春
郝光飞
,
韩东飞
and
date:
04/13/2021,
view:
4276,
Q&A:
0
... 图3. rRNA的
杂交
捕获
(MICROB Express Kit说明书)五、 纯化后mRNA质量的测定。 方法同上文总RNA质量检测。六、 片段化处理。
捕获
Oligo MagBeads,并将富集的mRNA上清液移至收集管。 此处将对rRNA消减
杂交
法进行详细说明,其余方法详细步骤及原理可在附件查看。 图2. 细胞内RNA分布图 rRNA消减
杂交
法。 其原理为:16S和23S rRNA与总RNA样本进行
杂交
,使用与r