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锁核苷酸PCR解析植物内生细菌多样性方法
Locked Nucleic Acid (LNA) Oligonucleotide PCR Clamping Method for Investigating the Plant Endophyte Bacteria
Authors:  于镇华Makoto Ikenaga, Masao Sakai, 王光华 and date: 04/13/2021, view: 3328, Q&A: 0
比如，想用DGGE技术来研究植物内生细菌多样性，那么，由于第一步PCR反应的产物片段较长，不适用于DGGE技术 (片段长度最好小于500 bp)，因此需要通过第二步PCR扩增缩短片段长度；如果想进行二代高通量测序 LNA-PCR扩增后来自叶绿体和线粒体的序列分别占序列总数的0.13%和0.88%，而未采用LNA-PCR扩增后来自叶绿体和线粒体的序列分别占序列总数的93.15%和4.23%，进一步说明本方法在研究植物内生细菌多样性方面的优势 施用有机肥对侵蚀黑土玉米苗期根内生细菌多样性的影响. 应用生态学报
结构方程模型在土壤微生物生态学中的应用
Applications of Structure Equation Modeling (SEM) in Soil Microbial Ecology
Authors:  杨腾褚海燕 and date: 04/13/2021, view: 7058, Q&A: 0
... (F.richness和P.richness)分别代表土壤真菌和地上植物的多样性。 实验步骤测试数据与理论模型 本文的测试数据来源先前对青藏高原高寒草地土壤真菌多样性分布规律的研究(Yang et al.，2017)，涉及60个100 × 100 m样地的地上植物多样性、土壤真菌多样性 具体的数据操作中，我们以年降雨(MAP)代表气候，以土壤总氮(TN)代表土壤养分，以土壤碳氮比(C:N ratio)代表土壤化学计量，以生长季NDVI的均值(NDVI mean)代表地
Marker Genes (16S and ITS) Protocol for Plant Microbiome Analyses
植物微生物组分析的标记基因（16S 和 ITS）实验方法
Author:  Geoff Zahndate: 04/20/2022, view: 1554, Q&A: 0
... [摘要]植物科学中的许多研究问题都依赖于对植物微生物组的调查。当问题取决于回答“谁在那里”而不是“他们在做什么”时，询问微生物组最具成本效益的方法通常是通过有针对性的元扩增子调查。 ... 观察计数、香农和辛普森多样性测量的 Alpha 多样性箱线图。 生活在夏威夷本土双子叶植物叶子内的真菌群落由景观尺度变量以及寄主植物构成。摩尔生态 29 (16):