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An Analysis Pipeline for Identification of RNA Modification, Alternative Splicing and Polyadenylation Using Third Generation Sequencing
使用第三代测序鉴定 RNA 修饰、可变剪接和多聚腺苷酸化的分析流程
Authors:
Yuxiang Liufu
Xuqing Liu
,
Lin Wu
,
Hangxiao Zhang
,
Yubang Gao
,
Lianfeng Gu
and
date:
06/05/2022,
view:
1369,
Q&A:
0
... Nanom6A提供了使用 Nanopore 直接 RNA 读数来鉴定定性和
定量
m 6 A 的方法,基于XGBoost算法以单碱基分辨率修改,提供 m 6 A 的高精度全转录组鉴定、
定量
和序列上下文 ( ... 使用纳米孔
测序
对天然 RNA 中的假尿苷化动力学进行
定量
分析。 Nat Biotechnol 39(10):1278-1291。4. 使用 Nanopore 直接 RNA
测序
在毛果杨茎分化木质部中以单碱基分辨率
定量
分析 N 6 -甲基腺苷。 基因组生物学22(1):22