真菌基因组的搜索结果

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基于二代测序的真菌基因组组装和注释
Assembly and Annotation of Fungal Genome Based on Illumina Sequencing
Authors:  马紫英吴琦, 周欣, 李宽, 蔡磊 and date: 03/25/2021, view: 8157, Q&A: 0
、注释和比较的综合软件（Palmer, 2016），最初是为注释真菌基因组 (小型真核生物，基因组大小约30 Mb) 而写的，经过不断更新目前也可以用于较大的基因组。 SPAdes适用于细菌/真菌等小型基因组的组装，不适用于大型基因组，输入数据可以是Ion Torrent, PacBio, Oxford Nanopore, 以及Illumina paired-end, 对于小型真菌基因组的Illumina paired-end rea
Extraction of Orthologs from Genome-Sequencing Data for Phylogenetic Analysis
从基因组测序数据中提取直系同源基因用于系统发育分析
Authors:  Guan PangFeng M. Cai and date: 06/05/2024, view: 592, Q&A: 0
... 这是使用五种真菌基因组完成的，其中四个主要成员属于木霉属。木霉属是研究最深入的丝状真菌群之一，因为它们在从农业到工业酶生产的应用方面具有很高的价值 [9]。 ... 当前协议使用来自美国能源部联合基因组研究所 (JGI) [13] MycoCosm 中的五种真菌菌株 [9,11,12] 的基因组数据集。本协议中使用的每种真菌菌株的数据资源如下所示，可在注册后下载。
The Canu Genome Assembly Pipeline Using Nanopore Long Reads
使用 Nanopore Long Reads 的 Canu 基因组组装流程
Authors:  Guifang LinSanzhen Liu and date: 09/05/2022, view: 1648, Q&A: 0
... 小型真菌数据集用于说明管道。该管道已被证明可以生产高质量的真菌和植物基因组基因组组装。图形摘要： 从原始数据到基因组组装的流程图。 该管道包括三个主要步骤：碱基调用、读取组装和组装重叠群的抛光。
牧草种子内生真菌的分离、鉴定与保存方法
Isolation, Identification and Preservation of Endophytic Fungi from Forage Seeds
Authors:  强晓晶李玉中 and date: 04/12/2021, view: 3519, Q&A: 0
刮取适量PDA平板上培养一周的内生真菌菌丝体，根据真菌基因组DNA提取试剂盒说明书，提取分离到的内生真菌的基因组DNA。用ITS通用引物扩增内生真菌的ITS片段序列 (T. J. 国药集团，catalog number: 7681-82-9)硫酸链霉素 (沃凯，catalog number: 3810-74-0)甘油 (国药集团，catalog number: 56-81-5)真菌基因组 二、 牧草种子内生真菌的鉴定及保存方法牧草种子
药用植物地下茎内生真菌的分离纯化及鉴定
Isolation, Purification and Identification of Endophytic Fungi in Chinese Medicinal Plant Underground Stem
Authors:  祝英巩晓芳, 杨晖, 周剑平, 王治业 and date: 06/30/2021, view: 3525, Q&A: 0
用真菌基因组DNA试剂盒，按照说明书操作提取总DNA。 number: D810588)琼脂 (北京鼎国昌盛生物技术有限责任公司，VETEC, catalog number: V900500)ITS通用引物订购 (生工生物工程 (上海) 股份有限公司，合成部)真菌基因组 利用本研究提供的内生真菌分离方法，能可靠的分离、获得地下茎的内生真菌。该方法简单、易于操作，不但适用于药用植物地下茎内生真菌的分离，还可以推广应用到植物的根、茎和叶等内生真菌的分离。
原生质体法制备根系腐生型共生菌 (伞菌目) 单核化菌丝
Protoplast Regeneration to Obtain Monokaryotic Strain from the Quercus-Associated Clitopilus hobsonii
Authors:  王玉宸王欣玉, 彭龙, 袁志林 and date: 04/27/2021, view: 3615, Q&A: 0
... 笔者认为破译该菌的遗传信息可能为丰富外生菌根真菌起源于腐生真菌这一学说提供更多的基因组进化证据。 单核化作为“简化”复杂基因组的一种策略，是有效开展异核双核真菌全基因组测序分析的重要环节。因此，制备荷伯生氏斜盖伞单核体菌株将为顺利开展基因组测序和组装奠定基础。 0.45 μm滤膜50 ml离心管荷伯生氏斜盖伞双核体菌株DAPI (sigma, catalog number: D9542) 细胞壁裂解酶 (sigma, catalog number: L1412)