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原核微生物群落随机性和确定性装配过程的计算方法
Calculation Method for Stochastic and Deterministic Assembly Processes of Prokaryotic Communities
Authors:
赵维
王兴彪
,
侍浏洋
,
朱婉瑜
,
马磊
,
王敬敬
,
徐松
,
杨榕
,
张小霞
,
韩一凡
,
黄志勇
and
date:
03/25/2021,
view:
8624,
Q&A:
0
关于样品采样深度对该方法计算结果的影响,目前尚无系统性的报道,根据已有报道基于该方法进行的研究显示Stegen等 (Stegen et al.,2012) 研究随机和
确定性
过程
对不同深度的沉积物样品的相对影响时 次计算得到的βMNTD值的标准差 mt.sd βNTI<-(comdist.result-mt)/mt.sd 最终,得到的βNTI值为4.93,说明S1和S2两个样方的群落之间的变化主要由
确定性
过程
影响 NTI和βNTI计算
过程
已经排除了物种数量对系统发育的影响。 针对多个样本
群落构建过程的定量指标——扩散-生态位连续体指数
Dispersal-niche Continuum Index: A Quantitative Metric of Community Assembly Processes
Authors:
孟凡凡
Annika Vilmi
,
Corentin Gibert
,
王建军
and
date:
04/29/2021,
view:
8792,
Q&A:
0
现有的研究表明,
确定性
过程
和随机性
过程
在群落构建中均发挥作用,二者是相容互补而不是绝对对立的。 因此,越来越多的研究开始整合生态位理论和中性理论,并探究群落构建中
确定性
过程
和随机性
过程
的相对贡献大小。 生态位理论和中性理论是目前较为成熟的两种群落构建理论,分别代表了群落构建中的
确定性
过程
(如生态位分化等)和随机性
过程
(如扩散作用等)。 但是,由于多数生物群落的构建往往同时受到
确定性
过程
和随机性
利用R软件在GBIF网站下载和筛选物种分布记录并提取气候数据进行分析
Exploring GBIF Database and Extracting Climate Data from Georeferenced Localities with R Software
Authors:
Anderson Feijó
葛德燕
,
温知新
,
程继龙
,
夏霖
,
杨奇森
and
date:
05/28/2021,
view:
18258,
Q&A:
3
... 在这里,将简单地删除不
确定性
超过100公里的记录。但如果有更精确的坐标信息便可以减少这种不
确定性
。 需要注意的是,因为数据库一直在更新,这个数字可能会变动,因此使用本流程
过程
中可能会有部分数值有一些小范围的变动。 它们可用于预测生物入侵、物种对全球变暖的敏感性、生态位进化对物种多样性的影响、气候驱动的物种形成和灭绝
过程
等。关于历史、现在和未来环境下的温度和降水的详细信息现在也可以在线获得。 数据过滤
过程
需要更仔细地查看整个数据集。使用R包的自动检测应该是检测和删除不准确记录的步骤之一,而不是唯一的
微生物生物地理学研究方法
Research Methods of Microbial Biogeography
Authors:
彭子恒
焦硕
,
韦革宏
and
date:
06/01/2021,
view:
4660,
Q&A:
1
... 生态群落构建
过程
分析结果
确定性
过程
(50%) 和随机性
过程
(50%) 共同解释了细菌群落的分布。