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Likelihood Estimation of Arabidopsis Population Parameters with MAPGD
基于MAPGD的拟南芥群体参数的似然估计
Authors:  Yue HaoMatthew S. Ackerman, Michael Lynch and date: 08/20/2023, view: 276, Q&A: 0
... 我们估计了等位基因和基因型频率、平均杂合性、相关性和其他群体参数。 该管道可应用于进一步的植物种群基因组研究。 ... 水蚤群体基因组学。 遗传学206(1): 315 – 332。Maruki, T. 和 Lynch, M.
群体基因组水平的适应性位点检测
Detecting Adaptive Loci with Population Genomic Data
Authors:  金铃郭宝成 and date: 07/23/2021, view: 5416, Q&A: 0
近年来，随着高通量测序技术的发展，群体基因组学数据和研究方法逐步应用于鱼类的本地适应 (local adaptation) 研究中 (López et al., 2015; Bernatchez, 2016 --recode-INFO-all --stdout | gzip -c > chr1.SnpGap10.xindels.vcf.gz 由于一些生信分析软件仅支持分析双等位基因，为了方便进行其他群体基因组学分析 本地适应是指某群体相比于其他群体更适应其所在生境的进化过程 (Sa
物种树构建后的基因渗入检验方法
Methods of Detecting Introgression after Species-tree Construction
Authors:  丁颖纪繁迪, 黄华腾 and date: 02/10/2022, view: 9286, Q&A: 1
... 基因渗入的具体模型可以是群体遗传学的经典基因流模型：一个群体的基因拷贝在每一代中有一定比例迁移到另一个群体中，这种迁移将持续一段时间 (Hey and Nielsen, 2004; Nielsen and 随着高通量测序技术的发展，系统发育迎来了系统发育基因组学 (phylogenomics) 的时代 (于黎和张亚平, 2006)。 系统发育基因组学——重建生命之树的一条迷人途径. 遗 传 28(11): 1445-1450. (B) 和 (C) 中两个溯祖事件都发生在三个物种的共同祖先群体
Identification of Expression QTL by QTLtools in a Rice Recombinant Inbred Line Population
水稻重组自交系群体中利用QTLtools鉴定QTL的表达
Authors:  Feng XiongHu Zhao, Weibo Xie and date: 06/20/2022, view: 900, Q&A: 0
... [背景] 全面的eQTL研究需要首先获得群体中每个个体的遗传标记和表达谱，然后将每个目标基因的表达作为一个性状（称为表达性状， eTrait ） 并通过关联分析确定某些标记是否与eTrait在统计上相关 ... 人类基因组学。基因型-组织表达 (GTEx) 初步分析：人类多组织基因调控。 科学348（6235）：648-660。 数据源 籼稻品系（珍山97 和明慧63）杂交的 210个水稻重组自交系（ RILs ）群体（ Xing 等。 , 2002)