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微生物群落构建过程的空间可视化方法
Spatial Visualization of Microbial Community Assembly Processes
Authors:  闫慧贞王凯, 张德民 and date: 02/10/2021, view: 4632, Q&A: 0
Taxon Index,最近种间指数) 和RCBray (基于Bray-Curtis非相似性的Raup-Crick指数) 数值矩阵 (Stegen et al., 2013),能反映主导成对样本间微生物群落周转的各种生态过程 ,即群落构建过程。 成对站位群落构建过程属性表在ArcGIS中将群落构建过程属性表与站位经纬度表链接,并根据各类过程调整成对站位连线颜色4.1将群落构建过程属性表链接至站位经纬度表 右击步骤2.3中经XY To Line 将成对采样站位之间的微生物群落
原核微生物群落随机性和确定性装配过程的计算方法
Calculation Method for Stochastic and Deterministic Assembly Processes of Prokaryotic Communities
Authors:  赵维王兴彪, 侍浏洋, 朱婉瑜, 马磊, 王敬敬, 徐松, 杨榕, 张小霞, 韩一凡, 黄志勇 and date: 03/25/2021, view: 8624, Q&A: 0
对于成对的群落比较,βNTI (βNRI) <-2或>+2分别表示小于或大于预期的系统发育周转。 这种度量量化了群落装配之间的系统发育距离;βMNTD被使用是因为它强调短的系统发育距离的系统发育周转率,其中大力支持系统发育信号的假设。 2.4βNTI/βNRI 为了推断出对特定群落装配之间观察到的周转率起主要作用的生态因素,鉴于随机性生态过程的主导地位,使用零模型方法生成一个预期水平的βMNTD (βMPD)。 在所有成对比较中获得的平均βNTI (βNRI)
群落构建过程的定量指标——扩散-生态位连续体指数
Dispersal-niche Continuum Index: A Quantitative Metric of Community Assembly Processes
Authors:  孟凡凡Annika Vilmi, Corentin Gibert, 王建军 and date: 04/29/2021, view: 8792, Q&A: 0
null model)分析框架,通过将观察到的物种类群划分为不同的bin,根据单个bin在群落或样本间的周转情况,并结合bin的相对多度,定量推断群落水平的构建过程。 DNCI指数用于定量β层次的群落构建过程,即群落组间而非群落组内,这与以往的群落构建定量方法迥异,从而突破了传统意义上α层次的群落构建认知,发展了一个崭新视角定量评估群落构建特征(如图2)。图2. 同时,现有的定量方法仅关注α层次的群落构建过程,即
土壤水稳性团聚体微生物组样品制备方法
Methods for the Preparation of Microbiome in Water-stable Soil Aggregates
Author:  郑伟date: 04/22/2021, view: 3304, Q&A: 0
... 真菌、细菌参与土壤团聚体周转模式图材料与试剂0.2 M CaCl2溶液50 ml 离心管250 ml 离心瓶无菌水 (见溶液配方)仪器设备土壤团聚体湿筛仪 (浙江托普云农科技有限公司)图2. 另外本方法仅对团聚体湿筛法的步骤做了详细描述,干筛法和湿筛法略有区别(湿筛法需要用水浸润,主要筛分水稳性团聚体),在Jiang et al.
沉积物中溶解性有机质的提取
Extraction of Dissolve Organic Matter from Sediment Samples
Authors:  袁海军胡盎, 刘金福, 耿梦蝶, 刘勇勤, 王建军 and date: 01/12/2022, view: 9609, Q&A: 0
... 作为影响水陆环境的关键参数,DOM频繁参与微生物群落的复杂代谢过程。同时,微生物对其大小、组成以及周转等方面也表现出很强的调节作用。