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Workflow of Genome-Wide Mediation Analysis (GMA) by Incorporating Intermediate Omics Data as Mediators
结合中间组学数据的全基因组中介分析(GMA)工作流程
Authors:  Zhikai YangQi Zhang, Jinliang Yang and date: 07/20/2024, view: 305, Q&A: 0
... 中介分析作为一种统计因果推断方法,为这三个变量建立了因果链,即从基因型作为暴露因素,到中间分子过程(即基因表达)作为中介,最终到常规表型作为结果。 ... 全基因组关联研究 (GWAS) 统计方法概述。Methods Mol Biol. 1019: 149–169。 表型矩阵(或 y 矩阵)。 行代表植物基因型,列代表感兴趣的性状(相对于原始表型,建议使用
Identification of Expression QTL by QTLtools in a Rice Recombinant Inbred Line Population
水稻重组自交系群体中利用QTLtools鉴定QTL的表达
Authors:  Feng XiongHu Zhao, Weibo Xie and date: 06/20/2022, view: 914, Q&A: 0
... eQTL结果可用于构建遗传调控网络以及增加我们对表型变异调控机制的理解。 [背景] 全面的eQTL研究需要首先获得群体中每个个体的遗传标记和表达谱,然后将每个目标基因的表达作为一个性状(称为表达性状, eTrait )