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Maize Genome Assembly with PacBio Reads
利用PacBio Reads组装玉米基因组
Authors:  Ying HuMarcio F. R. Resende Jr. and date: 07/05/2022, view: 1177, Q&A: 0
... 与 Illumina 短读长相比,PacBio 长读长通常具有相对较高的错误率,尽管最近化学和碱基调用算法的改进显着提高了长读长测序质量。 ... FastQC (Andrews, 2010) 适用于短读长的质量控制,但不适用于 PacBio 长读长的质量控制,后者没有有意义的Phred质量分数。
The Canu Genome Assembly Pipeline Using Nanopore Long Reads
使用 Nanopore Long Reads 的 Canu 基因组组装流程
Authors:  Guifang LinSanzhen Liu and date: 09/05/2022, view: 1667, Q&A: 0
... 使用纳米孔长读长测序技术,单链 DNA 或 RNA 分子在运动过程中通过影响离子电流的纳米孔蛋白(Jain et al., 2016) 。 ... INDEL 是长读长测序的常见错误类型。讨论最终基因组组装的总长度为 124,197 bp,其中包含重叠群中间的 50 kb 参考序列。
Analysis of DNA 5-methylcytosine Using Nanopore Sequencing
使用纳米孔测序分析 DNA 5-甲基胞嘧啶
Authors:  Zhuowen LiLihao Zheng, Jixian Zhai, Yanping Long and date: 02/05/2024, view: 718, Q&A: 0
... 如今,纳米孔测序能够直接检测天然单分子长读长DNA上的DNA修饰,克服了短读长亚硫酸氢盐测序的局限性。 ... 使用 TAPS 进行准确的靶向长读 DNA 甲基化和羟甲基化测序。基因组生物学。 21(1):54。 https://doi.org/10.1186/s13059-020-01969-6刘,Y.