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使用BEAST 2开展贝叶斯支端定年分析
Using BEAST 2 for Bayesian Tip Dating
Authors:  罗阿蓉张驰, 朱朝东 and date: 07/15/2021, view: 6093, Q&A: 0
常用的贝叶斯定年方法可以分为两类，一类是节点定年 (node dating)，另一类是支端定年 (tip dating)，其主要区别在于如何利用化石的信息。 这种 (非全证据) 的贝叶斯支端定年特别适用于分子数据不断涌现但形态特征数据相对稀缺的系统基因组学时代。 所以，对于贝叶
使用MrBayes开展贝叶斯支端定年分析
Bayesian Tip Dating using MrBayes
Authors:  张驰罗阿蓉 and date: 07/23/2021, view: 3890, Q&A: 0
近些年开发的贝叶斯支端定年法 (Bayesian tip dating) 为该问题提供了一个可行的解决方案。 MrBayes起始运算的屏幕输出小结与建议本文演示了如何利用MrBayes进行贝叶斯支端定年分析。大致流程主要包括下载软件，准备数据，准备命令文件、运行软件和查看结果。 本文着重分析离散的形态特征数据，这类数据是支
蜻蜓分类学入门指导
A Preliminary Guide of Taxonomy of Odonata
Authors:  于昕陈雪伊, 张敏 and date: 12/14/2021, view: 11366, Q&A: 0
... 对于蜻蜓，根据本实验室的经验，应用COI和ITS序列分别单独进行支序分析，构建最大似然 (ML) 树和贝叶斯 (BI) 树，通常可得到满意的鉴定结果 (图16)。 包括传统的依据遗传距离阈值的方法，除了直接计算样本间遗传距离外，目前ABGD最为流行；基于遗传聚类思想的鉴定方法也比较多，其中MOTUs比较常用；基于似然算法理论的方法如GMYC；还有基于碱基替换模型的PTP方法及融入了贝叶斯算法的 大蜓类稚虫下唇- 下唇须叶端缘具