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DNA条形码算法及软件开发
Algorithms and Software Development of DNA Barcoding
Authors:  张爱兵杨炳, 王瑛, 杨采青 and date: 10/15/2021, view: 4560, Q&A: 0
软件的安装与编译：FuzzyID2 是使用 C++ 和 Python 编写的运行在 Linux 平台的命令行程序，调用了 HMMER3.0 软件库来为第一步搜索加速，调用 Bio++ v2.1.0 软件库用于计算遗传距离 ，对最新的算法及软件进行了介绍，并提供了常用 DNA 条形码的下载链接，建议研究人员根据课题研究需要选择合适的分析方法及软件进行使用。 该软件包主要用途是进行物种识别和条形码分析。 主要函数及功能：BarcodingR 软件包以软件包
基于ArcGIS和R软件进行动物地理区划
Delineating Zoogeographical Regions Using ArcGIS and R Software
Authors:  何杰坤郜二虎, 余杰华, 彭伟鑫, 陈琳, 江海声 and date: 08/13/2021, view: 4671, Q&A: 0
二、在R软件里读取和处理物种分布和系统发育树数据# 打开R软件，安装以下函数包。 软件和相关软件包ArcGIS 10.2 (ESRI Inc., Redlands, CA, USA)R software version 4.0.4 (https://www.r-project.org 值得注意的是，以上在ArcGIS中的操作，R软件也提供了可选的解决方案。 特别是内嵌在ArcMap中的ArcToolbox软件模块，具有许多高效实用的空间处理功能。
基于Drishti软件的古生物的三维分割和重建方法
A 3D Segmentation & Reconstruction Method in Paleontology Using Drishti
Authors:  胡雨致Ajay Limaye, 卢静 and date: 10/28/2021, view: 2658, Q&A: 0
目前市面上已有很多功能完善的三维分割和重建商业软件，例如Mimics，VG Studio和AVIZO，这些软件能为三维物体表面和体渲染提供多功能和良好的渲染输出。 但是，对于三维科学可视化领域中可免费获得且易于访问的开源软件的潜力、使用方法及其应用场景，目前学界尚未完全了解。 Drishti软件具有三个模块：Drishti Import (导入)，Drishti Renderer (渲染) 和Drishti Paint (绘制)。 软件安装说明Drishti v2.7 (Windows和Linux版本)
16S扩增子分析中常用软件及数据库应用现状
The Application Status of Commonly Used Software and Database in 16S Amplicon Analysis
Authors:  杨潇瀛张浩林, 韩莹莹, 翁强, 袁峥嵘 and date: 04/23/2021, view: 9821, Q&A: 0
在众多软件之中，选取适合自身高效的分析软件成为科研中不可或缺的一步。为此本文综述了在16S扩增子分析中常用的软件以及数据库，总结了其优缺点以供初学人员参考选择。 软件和数据库 16S扩增子分析中常用软件1.1主流分析软件 (表1)1)mothur：2009年2月发布了mothur的第一个版本，目前被引用13,658余次，是由美国密歇根大学Patrick D. 该软件实现了从分析原始数据到绘制发表级图表的全部功能流程，已被引用21,300余次，是目前使用最多的扩增子分析
利用R软件在GBIF网站下载和筛选物种分布记录并提取气候数据进行分析
Exploring GBIF Database and Extracting Climate Data from Georeferenced Localities with R Software
Authors:  Anderson Feijó葛德燕, 温知新, 程继龙, 夏霖, 杨奇森 and date: 05/28/2021, view: 18259, Q&A: 3
R是一个广泛应用于科学领域的免费软件，能在其中进行各类数据管理、可视化、统计分析和建模，有大量的软件包可供使用，是进行不同生物类群空间分布分析的理想选择。 #打开Rstudio, 安装以下软件包(图2). 在过去的研究中，人们常常是基于手动搜索、下载和处理这些数据，需要使用到多个软件，耗费大量的时间，非常不方便，这就迫切需要有功能强大的软件来高效地完成这些工作。 学习如何使用这些软件包获取和分析与物种分布相关的气候条件并探讨它们与物种性状(如体型)的相互关系，能够提升检验相关生物学假设的