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Workflow of Genome-Wide Mediation Analysis (GMA) by Incorporating Intermediate Omics Data as Mediators
结合中间组学数据的全基因组中介分析(GMA)工作流程
Authors:  Zhikai YangQi Zhang, Jinliang Yang and date: 07/20/2024, view: 305, Q&A: 0
... GMA 可以识别直接影响最终表型的单核苷酸多态性 (SNP),或通过中间组学数据中介间接影响最终表型。当将转录组学数据视为中间性状时,该方法可以精确定位特定基因作为连接基因型和表型的转录中介。 ... 表中:pmed.pure,介导方差的比例;v.tot,总效应的方差;v.med,间接效应的方差;v.dir,直接效应的方差;n.med,在调整以控制介质选择中的错误发现比例 (FDP)
结构方程模型在土壤微生物生态学中的应用
Applications of Structure Equation Modeling (SEM) in Soil Microbial Ecology
Authors:  杨腾褚海燕 and date: 04/13/2021, view: 7058, Q&A: 0
... SEM路径图(a)及各因子对土壤真菌多样性的直接和间接作用(b)。(a)路径旁边的数字为标准化的路径系数,括号内为对应P值。绿色为负效应,红色为正效应,只有显著的路径被保留。 此外,根据路径系数的加乘运算,我们以表格的形式展现出各因素对土壤真菌多样性分布的总的、直接和间接作用(图13b)。 通过路径分析获得路径图和路径系数, 研究者可以对系统内各因子的关系进行分解并揭示这些关系背后的潜在机理, 确定不同因子对同一过程的直接和间接作用, 并判别它们的相对重要性等(王酋石和储诚进,2011)。 注:各