COI条形码的搜索结果

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基于高通量测序的全长DNA条形码获取方法
Methods for Obtaining Full-length DNA Barcodes Using High-throughput Sequencing
Authors:  杨琛涛周程冉, 刘山林, 周欣 and date: 08/25/2021, view: 5399, Q&A: 0
2)组装算法:采用SOAPBarcode算法 (图4) 对条形码序列进行填充,从而获得高精度的完整的昆虫COI基因条形码。 条形码序列扩增与检测2.1引物标签设计 1)标签 (index) 设计考虑的因素:由于需要使用高通量测序技术对昆虫条形码COI序列进行测序和分析,因此在设计引物标签时需要综合考虑以下因素:a) 标签可识别性 2.2标签引物合成 按照标签表 (附录A表6) 设计出含标签序列的条形码引物:在标准引物的上 (下) 游的5'端添加正向 (反向)
眼蕈蚊科昆虫的采集、制作与物种鉴定
Collecting, Preparation and Identification of Black Fungus Gnats (Diptera: Sciaridae)
Authors:  刘彩霞王青云, 吴鸿, 黄俊浩 and date: 10/14/2021, view: 5342, Q&A: 0
... DNA条形码序列是线粒体基因组中一段短的标准的细胞色素c氧化酶亚基I (cytochrome C oxidase subunit I, COI) 基因片段,常用于许多类群中的物种鉴定、分 类和多样性分析 序列处理5.1采用双向测序,测序得到的COI原始序列使用ContigExpress软件观察序列峰图质量,并对每个碱基逐一人工校对,保证COI序列的可靠性。 近年来,DNA条形码技术在昆虫生物多样性和生物进化领域的研究逐步深入,多项昆虫国际条形码计划先后开展,极大地丰富了昆虫
DNA条形码算法及软件开发
Algorithms and Software Development of DNA Barcoding
Authors:  张爱兵杨炳, 王瑛, 杨采青 and date: 10/15/2021, view: 4707, Q&A: 0
,如 “Moths_COI.fasta”。 此前问询多条钩蛱蝶属 (Polygonia) 的 COI 数据,BOLD 识别结果均是白钩蛱蝶 (Polygonia c-album),而 GenBank BLAST 的结果是黄钩蛱蝶 (Polygonia incomplete lineage sorting) 现象 (Funk and Omland, 2003; McGuire normal;"> et al., 2007),会使得不同物种可能具有相同的 COI 数据的积累提高了 DNA 条形码识别的准确性,有利
赤眼蜂科及缨小蜂科系统分类与生物学特征研究方法
Systematic Identification and Biological Characteristic Research Method of Trichogrammatidae and Mymaridae
Authors:  康宁努日耶· 木合太尔, 胡红英, 朱丽得孜· 艾山 and date: 07/15/2021, view: 2794, Q&A: 0
... 本文主要介绍DNA无损伤提取法在赤眼蜂和缨小蜂DNA条形码研究中的应用,并总结了室内研究缨小蜂生物学特征的方法。 DNA条形码在新疆北部农田赤眼蜂科和缨小蜂科 (膜翅目:小蜂总科) 分类研究中的应用. 新疆大学. 赤眼蜂和缨小蜂COI和ITS2的引物序列表3. PCR扩增ITS2和COI的片段的反应体系表4. 基于COI基因和ITS2基因的系统进化树构建: 经过比对分析后的赤眼蜂科与缨小蜂科的COI基因和ITS2基因及NCBI数据库中获得的基因序列,通过遗传分析软件MEGA 7.
蜚蠊目昆虫的野外采集、标本制作和数据分析
Collection, Specimen Making and Data Analysis of Blattodea Species
Authors:  邓文波车艳丽, 李志强, 王宗庆 and date: 09/23/2021, view: 3909, Q&A: 0
... 常用的分子手段就是DNA条形码 (DNA Barcodes),线粒体细胞色素C氧化酶亚基I (COI) 基因的一段短的标准DNA 片段 (658 bp),被广泛地用于蜚蠊种类的鉴定以及雌雄配对。 样本的COI序列是用DNA提取试剂盒抽提出酒精标本的总DNA (提取步 骤参考DNA试剂盒说明书),然后用蜚蠊类群 normal;">COI的通用引物,通过PCR扩增这一段序列 (PCR体系以及程序设置参考 将人工校对后的COI序列直接放入ABGD网站进行物种界定分析,只修改参数X (rel
湖泊水体环境DNA的采集、提取与鱼类遗传标记的扩增
Collection and Extraction of Lake Water Environmental DNA and Amplification of Fish Genetic Markers
Authors:  舒璐潘红梅, 彭作刚 and date: 10/15/2021, view: 3623, Q&A: 0
... Balasingham等(2018)使用COI标记从加拿大南部的Grand河流和Sydenham河流中共检测出78种本地鱼类、4种濒危鱼类以及1种入侵鱼类,其检测结果与历史监测结果基本一致。 然而,环境DNA宏条形码无法提供目标物种的种群数量、年龄结构、生理状态和生长发育阶段等信息。 基于高通量测序的环境DNA宏条形码技术可以从一份环境样品实现对目标类群的多个物种的DNA检测,是评估鱼类多样性的有力工具。 MiFish-U引物是鱼类环境DNA宏条形码分析的常用引物,Tele02引物是基于MiFish-U引物的优化版
蚯蚓的野外采集、标本制作和群落分析流程
Protocols of Field Collection, Specimen Preparation and Community Analysis of Earthworms
Authors:  刘满强胥毛刚, 孙静, 王定一, 祁小旭, 蒋际宝, 胡锋 and date: 11/05/2022, view: 3550, Q&A: 0
... 2.2蚯蚓分子鉴定 蚯蚓条形码技术为非专业人士识别物种提供了技术手段。 Validation of the barcoding gene COI for use in forensic genetic species identification.Forensic Sci (6) DNA提取完成后用既定引物 (表2) 进行PCR扩增线粒体COⅠ序列 (条形码),电泳检测后将合格样品测序; (7) 获得的序列在NCBI等相关数据库中进行同源性搜索,匹配相似度最高的物种,但同时仍要进行形态学观察确认结果 LCO1490GGTCAACA