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COI条形码的搜索结果
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基于高通量测序的全长DNA条形码获取方法
Methods for Obtaining Full-length DNA Barcodes Using High-throughput Sequencing
Authors:
杨琛涛
周程冉
,
刘山林
,
周欣
and
date:
08/25/2021,
view:
5399,
Q&A:
0
2)组装算法:采用SOAPBarcode算法 (图4) 对
条形码
序列进行填充,从而获得高精度的完整的昆虫
COI
基因
条形码
。
条形码
序列扩增与检测2.1引物标签设计 1)标签 (index) 设计考虑的因素:由于需要使用高通量测序技术对昆虫
条形码
COI
序列进行测序和分析,因此在设计引物标签时需要综合考虑以下因素:a) 标签可识别性 2.2标签引物合成 按照标签表 (附录A表6) 设计出含标签序列的
条形码
引物:在标准引物的上 (下) 游的5'端添加正向 (反向)
眼蕈蚊科昆虫的采集、制作与物种鉴定
Collecting, Preparation and Identification of Black Fungus Gnats (Diptera: Sciaridae)
Authors:
刘彩霞
王青云
,
吴鸿
,
黄俊浩
and
date:
10/14/2021,
view:
5342,
Q&A:
0
... DNA
条形码
序列是线粒体基因组中一段短的标准的细胞色素c氧化酶亚基I (cytochrome C oxidase subunit I,
COI
) 基因片段,常用于许多类群中的物种鉴定、分 类和多样性分析 序列处理5.1采用双向测序,测序得到的
COI
原始序列使用ContigExpress软件观察序列峰图质量,并对每个碱基逐一人工校对,保证
COI
序列的可靠性。 近年来,DNA
条形码
技术在昆虫生物多样性和生物进化领域的研究逐步深入,多项昆虫国际
条形码
计划先后开展,极大地丰富了昆虫
DNA条形码算法及软件开发
Algorithms and Software Development of DNA Barcoding
Authors:
张爱兵
杨炳
,
王瑛
,
杨采青
and
date:
10/15/2021,
view:
4707,
Q&A:
0
,如 “Moths_
COI
.fasta”。 此前问询多条钩蛱蝶属 (Polygonia) 的
COI
数据,BOLD 识别结果均是白钩蛱蝶 (Polygonia c-album),而 GenBank BLAST 的结果是黄钩蛱蝶 (Polygonia incomplete lineage sorting) 现象 (Funk and Omland, 2003; McGuire normal;"> et al., 2007),会使得不同物种可能具有相同的
COI
数据的积累提高了 DNA
条形码
识别的准确性,有利
赤眼蜂科及缨小蜂科系统分类与生物学特征研究方法
Systematic Identification and Biological Characteristic Research Method of Trichogrammatidae and Mymaridae
Authors:
康宁
努日耶· 木合太尔
,
胡红英
,
朱丽得孜· 艾山
and
date:
07/15/2021,
view:
2794,
Q&A:
0
... 本文主要介绍DNA无损伤提取法在赤眼蜂和缨小蜂DNA
条形码
研究中的应用,并总结了室内研究缨小蜂生物学特征的方法。 DNA
条形码
在新疆北部农田赤眼蜂科和缨小蜂科 (膜翅目:小蜂总科) 分类研究中的应用. 新疆大学. 赤眼蜂和缨小蜂
COI
和ITS2的引物序列表3. PCR扩增ITS2和
COI
的片段的反应体系表4. 基于
COI
基因和ITS2基因的系统进化树构建: 经过比对分析后的赤眼蜂科与缨小蜂科的
COI
基因和ITS2基因及NCBI数据库中获得的基因序列,通过遗传分析软件MEGA 7.
蜚蠊目昆虫的野外采集、标本制作和数据分析
Collection, Specimen Making and Data Analysis of Blattodea Species
Authors:
邓文波
车艳丽
,
李志强
,
王宗庆
and
date:
09/23/2021,
view:
3909,
Q&A:
0
... 常用的分子手段就是DNA
条形码
(DNA Barcodes),线粒体细胞色素C氧化酶亚基I (
COI
) 基因的一段短的标准DNA 片段 (658 bp),被广泛地用于蜚蠊种类的鉴定以及雌雄配对。 样本的
COI
序列是用DNA提取试剂盒抽提出酒精标本的总DNA (提取步 骤参考DNA试剂盒说明书),然后用蜚蠊类群 normal;">
COI
的通用引物,通过PCR扩增这一段序列 (PCR体系以及程序设置参考 将人工校对后的
COI
序列直接放入ABGD网站进行物种界定分析,只修改参数X (rel
湖泊水体环境DNA的采集、提取与鱼类遗传标记的扩增
Collection and Extraction of Lake Water Environmental DNA and Amplification of Fish Genetic Markers
Authors:
舒璐
潘红梅
,
彭作刚
and
date:
10/15/2021,
view:
3623,
Q&A:
0
... Balasingham等(2018)使用
COI
标记从加拿大南部的Grand河流和Sydenham河流中共检测出78种本地鱼类、4种濒危鱼类以及1种入侵鱼类,其检测结果与历史监测结果基本一致。 然而,环境DNA宏
条形码
无法提供目标物种的种群数量、年龄结构、生理状态和生长发育阶段等信息。 基于高通量测序的环境DNA宏
条形码
技术可以从一份环境样品实现对目标类群的多个物种的DNA检测,是评估鱼类多样性的有力工具。 MiFish-U引物是鱼类环境DNA宏
条形码
分析的常用引物,Tele02引物是基于MiFish-U引物的优化版
蚯蚓的野外采集、标本制作和群落分析流程
Protocols of Field Collection, Specimen Preparation and Community Analysis of Earthworms
Authors:
刘满强
胥毛刚
,
孙静
,
王定一
,
祁小旭
,
蒋际宝
,
胡锋
and
date:
11/05/2022,
view:
3550,
Q&A:
0
... 2.2蚯蚓分子鉴定 蚯蚓
条形码
技术为非专业人士识别物种提供了技术手段。 Validation of the barcoding gene
COI
for use in forensic genetic species identification.Forensic Sci (6) DNA提取完成后用既定引物 (表2) 进行PCR扩增线粒体COⅠ序列 (
条形码
),电泳检测后将合格样品测序; (7) 获得的序列在NCBI等相关数据库中进行同源性搜索,匹配相似度最高的物种,但同时仍要进行形态学观察确认结果 LCO1490GGTCAACA