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Utilisation of Methylome Data to Identify Stably Unmethylated Regions in Plant Genomes
利用甲基组数据鉴定植物基因组中稳定的非甲基化区域
Authors:  Judith I. M. Eglitis-SextonLeroy M. Mangila, Haylie L. Andrews, Lee T. Hickey, Peter A. Crisp and date: 02/20/2024, view: 428, Q&A: 0
... 该方法确定基因组每 100 bp 片段的平均甲基化，并将片段分类为甲基化和非甲基化。 甲基与DNA 中胞嘧啶（5-甲基胞嘧啶）的 5' 碳共价连接通常称为 DNA 甲基化，5-甲基胞嘧啶有时被称为第五碱基 [1]。 ... 区域根据以下层次结构进行分类：如果图块在相关上下文中具有少于两个胞嘧啶，或者小于指定的读数覆盖阈值（例如，3-5×覆盖率），则将图块分类为缺失数据；如果 CHH 甲基化大于 15%，则为