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rna反转录后定量分析

徐金盼 |  2022-11-23  | DOI: 10.21769/BioProtoc.v1043
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视频简介RNA提取、反转录、荧光定量PCR系列实验操作简直是生物领域研究生的实验室基本生存技巧。相较于RNA提取,荧光定量PCR感觉要相对简单一些。
  • 视频介绍

一、视频摘要

Real Time PCR,即实时荧光定量PCR,也被称为定量PCRqPCR,是实时监测PCR扩增产物并进行解析的方法。一般进行定量PCR的目的,是为了进行mRNA的表达量分析,或者对RNA拷贝数进行定量,或者确定RNA病毒是否存在的定性分析,那么首先都需要进行反转录实验,将RNA反转录为cDNA



二、关键词

RNA 反转录 定量


三、实验样品信息,试剂、耗材或仪器

1. 样品信息

高质量RNA提取试剂盒(货号K0731

DNase(货号EN0771/EN0521)。

RevertAid Master Mix (货号M1631/M1632

2. 试剂和耗材

移液枪 枪头 dna模板 反转录酶


3. 仪器和软件

PCR仪 定量分析仪器 离心机


四、实验操作

1)细胞或组织加入Trizol后,室温放置5min使其充分裂解,这会让核酸蛋白复合物完全分离(可轻轻翻转离心管混匀)。

注意! 此时可放入-70℃长期保存。

212000rpm4℃10min,后取上清转入新的EP管中。EP管需作好标识,并注意防止字迹被有机溶剂侵蚀;

3)加入氯仿进行抽提,以去除蔗糖、蛋白等杂质,促进水相与有机相的分离。每1 ml Trizol至少加入0.2ml氯仿(1/5体积)。盖紧样品瓶盖,用手用力摇晃试管15s使其充分混匀,室温静置5min

注意! 不能使用vortex,否则引起DNA污染。

4)加入异丙醇沉淀水相RNA。加入氯仿静置完成后,12000rpm4℃,离心15min,此时分相为三层。小心地将上层水相转入新的1.5mlRNA酶离心管中(约400-500μl),再加入等体积的异丙醇(按照0.5ml异丙醇/ml Trizol加入),混匀后,室温放置10min或者-20℃1小时。

注意!加入氯仿离心后分相为三层。从上至下分别为:上层水相(含RNA)、中间层白色(含蛋白质和DNA)、下层红色(含蛋白质、DNA、苯酚及氯仿等)。吸取水相时不要吸取任何中间层物质!!!

若同时提取DNA和蛋白质,则可保留下层酚相存于4℃冰箱。若只提RNA,则弃下层酚相。

512000rpm4℃,离心10min,小心弃上清。(离心前RNA沉淀经常看不见,离心后在管侧或管壁形成胶状沉淀)。

6)加入75%乙醇洗涤RNA沉淀,以使RNA沉淀中的盐离子被充分溶解。加入1 ml 75%乙醇,将RNA沉淀弹起漂洗。每使用1 ml Trizol则至少使用1 ml 75%乙醇对RNA沉淀进行洗涤。

注意! RNA沉淀可保存在75%乙醇中,2-8℃一周以上,或者-20℃一年以上。

7RNA沉淀洗涤后,12000rpm4℃,离心10min。弃上清,注意不要倒出沉淀,剩余少量液体短暂离心后用枪头吸出,注意不要吸弃沉淀!

注意! 用75%乙醇洗涤RNA时,要洗两遍。

8)将EP管打开置于超净台吹干(大概15min左右)。RNA沉淀不能吹太干燥,因其完全干燥后很难溶解,但又要充分避免乙醇影响后续试验。

9)根据试验需要以及RNA沉淀多少,加入适量DEPC水(10-100μl),反复吹打混匀,充分溶解RNA

10)定量(Nanodrop):用紫外分光光度仪检测所提RNA,通过OD260/280

来检测RNA纯度及浓度。

五、注意事项

1. 高反转录酶的活性

该酶在高达48 ℃时仍具有活性,而且特异性和cDNA产量更高。较高温度下进行反转录,能够减少RNA的二级结构,增加反转录的效率

2. 在实验中必须采取以下措施:戴一次性干净手套;使用 RNA 操作专用实验台;在操作过程中避免讲话等。通过以上办法可以防止实验者的汗液、唾液中的RNA分解酶的污染。

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