首页     短视频

海绵共附生菌种的分离与培养

徐尧, 宋一昊, 屈滢鑫宁耀东 |  2023-12-08  | DOI: 10.21769/BioProtoc.v1411
观看次数: 2 次  复制链接
视频简介一、视频摘要
海绵共附生菌种是海洋微生物的重要组成部分,是海洋天然产物的重要来源,其次级代谢产物因结构新颖,且具有较强的活性,已经成为新药先导化合物发现的重要来源。本实验重点对海绵共附生菌种分离与培养的操作进行细致阐述,着重介绍了海绵样品的预处理及后续菌种单菌落划线纯化的过程,旨在提供较为完善的分离与培养的技术方法,为后续分析菌株多样性,发现强活性菌株,分离新颖的次级代谢产物奠定基础。
二、关键词
海绵共附生,分离培养,单菌落,平板划线法

其他详见附件
  • 视频介绍

一、视频摘要

海绵共附生菌种是海洋微生物的重要组成部分,是海洋天然产物的重要来源,其次级代谢产物因结构新颖,且具有较强的活性,已经成为新药先导化合物发现的重要来源。本实验重点对海绵共附生菌种分离与培养的操作进行细致阐述,着重介绍了海绵样品的预处理及后续菌种单菌落划线纯化的过程,旨在提供较为完善的分离与培养的技术方法,为后续分析菌株多样性,发现强活性菌株,分离新颖的次级代谢产物奠定基础。

 

二、关键词

海绵共附生,分离培养,单菌落,平板划线法

 

三、实验样品信息,试剂、耗材或仪器

1. 样品信息

海绵,由海军特色医学中心从东海海域采集,海军军医大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室保藏。

2. 试剂和耗材

2.1试剂

75%酒精、氯化钠、氯化镁、硫酸镁、氯化钙、碳酸氢钠、氯化钾、溴化钠、硼酸、硅酸钠、磷酸、六氯化二铝、氨、硝酸锂、蒸馏水、酵母粉、麦芽提取物、葡萄糖、琼脂粉、蛋白胨、放线菌酮、制霉菌素、新生霉素、萘啶酮酸

2.2耗材

一次性培养皿(无菌)、涂布棒、手术剪、镊子、15ml离心管、枪头、一次性接种环(无菌)、200μL枪头、1000μL枪头、75%酒精。

3. 仪器和软件

高压蒸汽灭菌锅(上海申安);

生物安全柜(ESCO);

超净台(淀山湖);

恒温震荡摇床(知楚);

恒温培养箱(Bluepard)。

 

四、实验操作

(一)实验器材准备及培养基的配置

1.将所有所需耗材用报纸包好高压蒸汽灭菌(115℃,30min)。

2.按配方配置人工海水、ISP2培养基(液体+固体)和YMPG培养基(液体+固体),灭菌(115℃,30min)。

3.将抗生素配成溶液后,用0.22μm滤膜过滤除菌。

(放线菌酮—乙醇、制霉菌素—DMSO、新生霉素—钠盐水溶液、萘啶酮酸—稀NaOH

4.待培养基灭菌后降温至50-60℃时加入灭菌抗生素溶液,摇匀,得到ISP2k培养基和YMPGk培养基(k为加抗生素)。

5.分别倒入一次性无菌平皿中,得到ISP2YMPGISP2kYMPGk平板,备用。

(二)海绵样本的处理与培养

1.使用75%酒精对海绵表面进行消毒。

2.分别取两块1cm3小块,用无菌人工海水清洗。

3.剪碎,分别加至100ml ISP2kYMPGk液体培养基内,28 180rpm,培养3天至浑浊。

4.分别吸取1ml培养液至9ml无菌人工海水中(稀释10倍),而后吸150μL至对应ISP2kYMPGk平板表面,用一次性无菌涂棒涂抹均匀,封口,28℃静置培养至长出单菌落。

5.挑取单菌落至对应ISP2YMPG平板上,进行划线操作,划好线后做好标记,封口,28℃静置培养。

6.重复上述操作至平板上为单一菌种。

(三)菌种测序及鉴定

1. 将单菌落平板邮寄至生工公司,利用16SrDNA ITS序列测序的方法进行种属鉴定。

 

五、注意事项

1.配制海水时,溶解海盐的容器不要用金属容器(铝铁等),防止对容器造成腐蚀及引起反应改变海水离子成份。

2.全程无菌操作,避免外来菌对实验结果造成干扰。

3.单菌落培养时应每隔一段时间进行观察,避免生长过多影响单菌落挑取。

4.抗生素于培养基灭菌后降温至50-60℃时再加入,避免失效。

5.固体平板要确保无气泡,均匀且不能过多,且平板保存不宜超过1周。

 

六、结果分析(可选)

(一)从海绵样本中通过多次分离培养得到纯种

 

(二)利用16SrDNAITS技术获得菌种种属信息(截取部分实验信息)

1.S6331-1菌株16SrDNA序列 558bp

CTCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACAGAGTTATCCAACTCCCAAACCCATGTGAACTTATCTCTTTGTTGCCTCGGCGCAAGCTACCCGGGACCCCGCGCCCCGGGCGGCCCGCCGGCGGACAAACCACAACTCTGTTATCTTAGTTGATTATCTGAGCGTCTTATTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCCTAAGCACAGCTTACTGTTGGGACTCTACGGCCCCCGTAGTTCCCCAAAGCCATTGGCGGAGTGGCAGTAGTCCTCTGAGCGTAGTAATTCTTTATCTCGCTTTTGTTAGGTGCTGCCCCCCCGGCCGTTAAACCCCCCAATTTTTTCTGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAA

2.数据库比对信息

3.种属信息

检测结果:Nigrospora oryzae(稻黑孢霉)

声明:该视频作品仅代表作者观点,用于共享科学技术。内容仅供大家参考,不代表本站立场。