摘要: 浮游细菌是水体中营浮游生活的原核生物,是水生态系统的重要组成部分。本文介绍了淡水水体中浮游细菌群落过滤富集方法和有关注意事项。本方法可应用于水体微生物研究,所收集的浮游细菌样品适用于下游的生物大分子提取、DNA和RNA测序等实验。
关键词: 淡水, 浮游细菌, 自由生细菌, 颗粒附着生细菌, 过滤收集
浮游细菌
浮游细菌是水体中营浮游生活的原核生物,具有极高的物种多样性,是淡水和海洋生态系统的重要组成部分,在物质循环过程中发挥关键作用。绝大多数细菌细胞 (个体)大小为0.2–2 µm。事实上,在自然水体中,浮游细菌有两种常见的生活方式:自由生和颗粒附着生。两类细菌在群落组成和生态功能等方面存在显著差异,我们有必要分别进行研究。水体中浮游细菌数量虽然很高,过滤富集是最常见的一种方法。本文以深水水库为例介绍淡水水体中浮游细菌群落采集、过滤富集及保存方法。
材料与试剂
- 聚碳酸酯滤膜 (3 µm/0.22 µm, 直径 47 mm, Millipore)
- 200 µm尼龙筛网 (绍兴华丰, 80目)
- 2 ml离心管 (KIRGEN, KG2111)
- 铝箔纸 (CLEANWRAP, CF-3)
- 盐酸 (国药集团, 10011018)
仪器设备
- 水深测深仪 (Speed Tech, SM-5)
- 多参数水质分析仪 (Hach, Hydrolab DS5)
- 采水器 (武汉轩仕霖, MY-013)
- 水泵及配套水管、电源 (丰远, FY-2-48DC)
- 不锈钢过滤器及配套玻璃滤杯、砂芯滤头 (天津津腾, JTFA0214)
- 循环水真空泵 (上海亚荣, SHZ-III)
- 抽滤瓶 (成都蜀牛, GG-17)
- 超低温冰箱 (Thermo, ULT1386-5v)
- 高压灭菌锅 (TOMY, SX-500)
- 5 L量杯
- 500 ml量筒
实验步骤
- 野外水体样品采集
- 浮游细菌过滤富集前准备
- 浮游细菌过滤富集
- 浮游细菌样品保存与仪器整理
致谢
感谢国家自然科学基金 (91851104, 31370471)、福建省自然科学基金 (2019J02016)的资助。
参考文献
- Xue, Y. Y., Yu, Z., Chen, H. H., Yang, J. R., Liu, M., Liu, L. M., Huang, B. Q. and Yang, J. (2017). Cyanobacterial bloom significantly boosts hypolimnelic anammox bacterial abundance in a subtropical stratified reservoir.FEMS Microbiol Ecol 93: fix118.
- Liu, M., Liu, L. M., Chen, H. H., Yu, Z., Yang, J. R., Xue, Y. Y., Huang, B. Q. and Yang, J. (2019). Community dynamics of free-living and particle-attached bacteria following a reservoir Microcystis bloom. Sci Total Environ 660: 501–511.
Copyright: © 2021 The Authors; exclusive licensee Bio-protocol LLC.
引用格式:续子杰, 肖鹏, 杨义刚, 杨军. (2021). 淡水浮游细菌群落采集、过滤与保存. // 微生物组实验手册.
Bio-101: e2003736. DOI:
10.21769/BioProtoc.2003736.
How to cite: Xu, Z. J., Xiao, P., Yang, Y. G. and Yang, J. (2021). Sampling, Filtration and Storage of Freshwater Bacterioplankton Community. // Microbiome Protocols eBook.
Bio-101: e2003736. DOI:
10.21769/BioProtoc.2003736.