ISBN: 978-1-951285-03-6

微生物组实验手册:架起各领域通向微生物组世界的桥梁

        微生物组学是从组学角度研究微生物群落的新兴学科。在过去20年里,微生物组学在人类、动物、植物和环境领域均取得了突破进展。每年有数万篇相关研究论文发表,扩展了我们对医学、生物学、地球科学、环境科学以及农业科学的认识。目前,在分析领域发表了一系列的标准化流程,如QIIME、USEARCH等,极大地推进了本领域的发展。人类微生物组计划(HMP)、地球微生物计划(EMP)、中国科学院微生物组计划等联合项目成立,也促进了微生物组学的迅猛发展。然而,这些计划主要专注于基础数据库和研究热点,在通用和个性化的实验与分析等方面仍缺少系统的实验方法,限制着广大同行深入开展本领域研究。与此同时,还存在着不同研究团队方法不统一、实验难重复、和同行研究不可比较等诸多问题。为解决以上问题,我们发起了微生物组实验手册(Microbiome Protocols eBook, MPB)项目。
        Bio-protocol中国编辑部联合宏基因组公众号共同发起MPB项目,旨在促进微生物组领域国内外华人科研团队之间的交流和合作,倡导科研团队注重实验方法的沉淀、分享与传播。希望本电子书能够填补微生物组领域实验方法专著的空白,解决实验和分析难重复的问题。同时推动实验标准化,积累标准化、格式统一的数据,为将来的大数据整合分析做准备,助力微生物组学研究的发展。
        MPB以微生物组(Microbiome) 为主题,包括样本制备、分离培养、扩增子、宏基因组、代谢组、数据分析、微生物学常用实验。按研究对象分类主要包括人、动物、植物、环境、通用、微生物等。
        自2020年7月MPB项目启动,已有352名研究人员和167位评审加入该计划。吸引了包括中国科学院遗传与发育生物学研究所、南京土壤研究所、微生物研究所、生态环境研究中心、城市环境研究所,中国农业科学院,北京大学,清华大学,浙江大学,中山大学,山东大学,扬州大学,西湖大学,南京农业大学等在内的125个研究所或大学的参与。目前,MPB第一版已于2021年11月正式在线发布,共有146篇实验方法完成同行评审并正式发表。本项目中所有文章开放获取,任何人可通过Bio-protocol官网(https://bio-protocol.org/bio101/mpb)、微信宏基因组公众号、Google Scholar、知网、CSDN等多种途径免费访问。
        为了提高本实验手册的质量以及方法的多样化,MPB将作为长期项目不断更新和发表最新方法,重点关注常用和前沿方法的征集和约稿。我们诚邀更多国内外优秀同行参与本项目,一起打造本领域可参考的方法百科全书,欢迎您的来稿

刘永鑫,褚海燕,白洋
2021年11月09日

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