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功能基因高通量定量方法
High-Throughput qPCR Assays for Functional Genes
Authors:  安新丽栗利娟, 周昕原, 黄福义, 朱永官, 苏建强 and date: 04/27/2021, view: 3495, Q&A: 0
3.5数据处理—计算功能基因拷贝数 1） 使用Canco软件获得各基因在各样本中的检出情况和Ct值(扩增循环数)，同时构建分别含有待检测的功能基因的标准质粒，根据已知浓度的标准质粒的Ct值绘制标准曲线 Ct值代表该基因在对应样本中的扩增循环数，Ct值越小意味着该基因在对应样本中的起始含量越高。 3） 将样本Ct值代入标准曲线公式，获得样本基因的绝对定量信息，统计各基因在各样本中的基因数目。 注：其中在表格中标注“0”
基于GraftM对功能基因进行物种注释
Taxonomic Classification of Microbes with a Given Function Based on a Specific Functional Gene
Author:  赵圣国date: 06/24/2021, view: 2998, Q&A: 0
GraftM (Boyd et al., 2018) 是用于功能基因注释的优秀软件，它通过对已知功能基因构建系统发育树 (含物种信息)，然后将查询功能基因定位到系统发育树，根据树上位置和距离，注释查询功能基因物种信息 与16S rRNA基因或ITS基因相比，功能基因常具有多个不同拷贝，难以作为系统发育的标签基因，无法根据基因序列组成和相似特点直接
利用GeoChip分析环境微生物功能基因群落结构
Analysis of Microbial Functional Gene Community Structure in Environmental Samples by GeoChip
Authors:  郭雪杨云锋 and date: 06/01/2021, view: 3123, Q&A: 0
功能基因芯片 (GeoChip) 在两种典型环境微生物群落分析中应用 的研究. 博士学位论文.
细胞内融合基因技术 (epicPCR) 测定功能类群多样性
Diversity of Functional Microbes Detected by epicPCR Technology
Authors:  沈文丽王尚, 邓晔 and date: 04/27/2021, view: 3853, Q&A: 0
本项目中融合硫酸盐还原菌的功能基因dsrB和16S rRNA所使用的引物信息引物名称引物序列 (5’-3’)F1 (dsrB-F1)GTGTAGCAGTTACCGCAR1-F2 (dsrB-R1_519R 结果与分析本课题组采用细胞内融合基因技术 (epicPCR) 对采集自十个西藏盐湖底泥的硫酸盐还原菌群落的系统分类和多样性进行了鉴定，并对影响该群落结构的环境因子进行了鉴别。 可参见如下结果：通过对融合的16S rRNA加dsrB基因的16S rRNA扩增子和epicPCR产物的测序，共检测到10个湖泊的微生物总群落的1