功能富集分析的搜索结果

  • Peer-reviewed
  • Preprint
  • Extracted from published research articles
  • 生物化学
  • 生物信息学与计算生物学
  • 生物物理学
  • 癌症生物学
  • 细胞生物学
  • 发育生物学
  • 免疫学
  • 微生物学
  • 分子生物学
  • 神经科学
  • 植物科学
  • 干细胞
  • 系统生物学
  • 相关性
  • 日期
  • 浏览量
GO/KEGG Enrichment Analysis on Gene Lists from Rice (Oryza Sativa)
水稻基因列表GO/KEGG富集分析
Author:  Yahui Lidate: 06/20/2022, view: 3219, Q&A: 1
... [摘要]在 RNA-seq 数据分析中,基因的功能富集分析已成为常规。许多富集分析软件和网络应用程序已经出现。 ... KEGG富集分析clusterProfiler 包可以在运行 KEGG 富集分析功能enrichKEGG时自动从 KEGG 数据库中检索 KEGG 注释数据。
mRNA-Seq差异表达一般流程及高阶分析
General Pipeline and Advanced Analysis of mRNA-Seq Differential Expression
Author:  谢忱date: 09/10/2021, view: 5655, Q&A: 0
因此,在功能富集分析环节需要针对这种基因间功效偏差进行校正,以避免导致得到的富集的功能条目 (Gene Ontology term或pathway) 仅仅是因为其中包含更多有高read/fragment 为了理解这一基因集合的生物学功能意义,需要针对其进行功能富集分析。 在差异表达分析过程中,不同基因由于各种原因 (详见功效分析) 被检验为统计显著的功效是不同的。 上文例子 (图5)
基因组水平的遗传负荷分析
Genomic Genetic Load Analysis
Authors:  胡靖扬匡卫民, 吴宏, 于黎 and date: 03/10/2021, view: 7862, Q&A: 11
结果出来之后,对应查看相应的 GO和KEGG功能富集分析结果。方法运用该流程已经成功运用在濒危动物穿山甲的遗传负荷检测中 (Hu et al. 2020)。 基因注释分析 对高频且纯合等位基因中功能缺失突变相关基因(LOF基因)进行功能注释。将LOF基因与人或小鼠进行同源基因确定,获得相关基因列表。 研究结果发现穿山甲的遗传负荷显著增加,其中LOF基因主要富集到与代谢和疾病相关的通路。 )等,会直接造成基因原有功能的丢失,影响基因的表达,因此是最直接的
动物微生物单细胞转录组分析工具:现状与未来发展方向
Authors:  赵李頔涵房楠楠, 王恺毅, 王海燕, 闫利平, 高云云 and date: 11/25/2025, view: 387, Q&A: 0
下游分析包括功能注释和富集分析。 富集分析富集分析用于系统性的揭示基因或分析特征在生物学功能、信号通路或调控网络中的分布和作用模式。 下游分析包括聚类、批次效应矫正、功能簇识别、细胞互作、伪时间轨迹和功能富集。 基序(K-motifs),最终设计两个工作流程对其进行细菌物种特异性的GO功能富集分析
野生动物微生物组数据平台构建的技术方法和实践挑战
Technical Frameworks and Practical Challenges in Developing Wildlife Microbiome Databases
Authors:  王恺毅杨蕊菁, 李雨霏, 赵李頔涵, 闫利平, 王海燕, 高云云 and date: 02/05/2026, view: 274, Q&A: 0
... CRAMdb [18] 则在动物微生物组成与功能的整合方面表现突出,能够支持跨研究的功能富集分析,但野外样本覆盖不足,程序化访问能力有限。 3.2 数据处理与分析3.2.1 学术综述 数据处理和可视化功能并非所有微生物组数据库的必备组成部分,尤其对于以数据存储与共享为核心服务的平台而言,但集成分析功能正逐渐成为趋势。 当前发布的V1.0版本作为平台建设的第一阶段成果,已完成核心数据内容的整理与主要功能模块的实现,相关宏基因组数