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鸟类多样性野外调查方法
Bird Diversity Field Survey Methods
Authors:  董哲含斯幸峰, 何兴成, 张尚明玉, 成宇文, 吴永杰 and date: 09/06/2021, view: 9582, Q&A: 0
鸟类多样性调查的主要目的是迅速掌握一个地区鸟类多样性的分布情况。因此,需要对一个地区主要生境的鸟类进行快速调查,以便掌握本地区的鸟类多样性状况。 对群落声多样性的分析可以在一定程度上揭示鸟类系统发育的多样性和鸟类群落的功能多样性 (Gasc, 2013)。 既可以通过对音频的解读直接分析出鸣叫的鸟类物种,也可以运用声景学的方法通过声景多样性分析方法直接分析该地区鸟类物种多样性。 群落声多样性 (Community Acoustic d
基于不等长序列估算单倍型多样性方法的教程
A Tutorial For the Method of Estimating Haplotype Diversity From Sequences With Unequal Lengths
Authors:  范平宋刚, 雷富民 and date: 09/23/2021, view: 2442, Q&A: 0
依据配对比较结果计算单倍型多样性和核苷酸多样性 将上述计算结果输入遗传多样性计算函数"GD_function()"即可,运行该函数即可输出对应单倍型多样性和核苷酸多样性计算结果 (见图示 遗传多样性常用的指标有核苷酸多样性 (π) 和单倍型多样性 (h) (Goodall-Copestake, 2016; Miraldo et al., 2016。 值得一提的是,作为遗传多样性的衡量指标,与核苷酸多样性
细胞内融合基因技术 (epicPCR) 测定功能类群多样性
Diversity of Functional Microbes Detected by epicPCR Technology
Authors:  沈文丽王尚, 邓晔 and date: 04/27/2021, view: 3852, Q&A: 0
整个微生物群落和SRP亚群落的α-多样性呈显著正相关 (R2 = 0.443,P < 0.05),β-多样性部分重叠 (图4),揭示了两者间的关系。表2. 微生物总群落和硫酸盐还原菌的α-多样性 (a) 与β-多样性 (b) 的对比按照epicPCR最初创始文章的方法,筛选出了120个高丰度的SRP-OTU (至少一个样本中为1%),并对其构建了进化树以观察进化分化 结果与分析本课题组采用细胞内融合基因技术 (epicPCR)
锁核苷酸PCR解析植物内生细菌多样性方法
Locked Nucleic Acid (LNA) Oligonucleotide PCR Clamping Method for Investigating the Plant Endophyte Bacteria
Authors:  于镇华Makoto Ikenaga, Masao Sakai, 王光华 and date: 04/13/2021, view: 3307, Q&A: 0
施用有机肥对侵蚀黑土玉米苗期根内生细菌多样性的影响. 应用生态学报, 2016, 27(8): 2663-2669.喻江. 玉米和大豆根内生细菌多样性及促生细菌鉴定评价. 东北农业大学. 2016. 比如,想用DGGE技术来研究植物内生细菌多样性,那么,由于第一步PCR反应的产物片段较长,不适用于DGGE技术 (片段长度最好小于500 bp),因此需要通过第二步PCR扩增缩短片段长度;如果想进行二代高通量测序
基于高通量测序技术的丛枝菌根真菌多样性研究方法
High-throughput Sequencing-based Method for Characterizing Biodiversity of Arbuscular Mycorrhizal Fungi
Authors:  付伟武慧, 陈保冬 and date: 04/22/2021, view: 6447, Q&A: 0
ITS是真菌多样性研究的通用区域,其在AM真菌多样性研究中的应用次之,但有逐渐增多的趋势。 下游的AM真菌多样性分析可以从ASV水平和VT水平同时进行,分析方法与其他微生物类似,例如使用Vegan软件包绘制AM真菌ASV水平的稀释曲线并计算其α多样性。 AM真菌多样性研究可用引物表1. AM真菌多样性研究可用引物列表及其优缺点引物组合 优点 缺点 参考文献 AML1/AML2 AMV4.5F/AMDGR 可以使用MaarjAM数据库。 可以在真菌群落水平上研究AM真菌的多样性
土壤和水体环境T4型细菌病毒g23基因多样性研究
Genetic Diversity of the Major Capsid Genes (g23) of T4-type Bacteriophages in Soil and Water Environments
Authors:  刘俊杰荆瑞勇, 王光华 and date: 01/10/2021, view: 5580, Q&A: 0
注意事项本研究是以T4型细菌病毒g23为例,介绍了环境噬菌体多样性的研究方法。 自然环境中T4型噬菌体g23基因多样性研究进展. 微生物学报 51(6) : 732-739.王光华,刘俊杰,朱冬,叶茂,朱永官. (2020).