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微生物组的定量宏基因组学和定量宏转录组学方法
Quantitative Metagenomics and Metatranscriptomics Methods of Microbiome
Authors:  黄昕瑜张璐, 袁凌, 鞠峰 and date: 04/13/2021, view: 6212, Q&A: 1
XJ220A SCS）Nanodrop OneC（Thermo）涡旋混合器（杭州奥盛 MTV-1）实验步骤内标序列和PCR引物的设计与合成 本流程通过人工合成的DNA和RNA内标物投加来实现微生物群落的定量宏基因组学和定量宏转录组学分析 内标序列设计的基本原则和注意事项 本流程通过人工合成的DNA和RNA内标物投加来实现微生物群落的定量宏基因组学和定量宏转录组学分析，内标序列在设计时需要满足以下几个条件： 1）该序列为受测环境样品或自然环境中不存在的序列 6.0221412927×1023 MDIS：DNA内标
果蝇基因组DNA制备
Drosophila Genomic DNA Preparation
Authors:  邓娟 刘南 and date: 06/20/2019, view: 5325, Q&A: 0
材料与试剂1.5 ml离心管动物基因组DNA抽提试剂盒 (生工生物工程(上海)有限公司, catalog number: B518221)氯仿异丙醇乙醇TrisHClEDTARNase A (10 mg /ml)TE buffer (见溶液配方)仪器设备移液器水浴锅 (上海精宏实验设备有限公司, model: XMTE-8112)小型高速离心机 (Eppendorf)一次性组织研磨杵(生工生物工程(上海 如溶液未变澄清，说明细胞裂解不彻底，应适当延长水浴时间，否则将可能降低DNA的得率或导致提取的DNA不纯。 1.1通常动物组织完全裂解需要
柑橘根际和根表微生物组样品的收集及核酸提取方法
A Protocol for Citrus Rhizosphere and Rhizoplane Microbiome Sample Collection and Nucleic Acid Extraction
Authors:  张云增徐进, Riera Nadia, 王年 and date: 04/12/2021, view: 3345, Q&A: 0
为了降低后续宏基因组和宏转录组数据中植物组织的污染程度，可使用无菌镊子挑取去除LifeGuard soil preservation solution土壤悬液中的柑橘根部组织。 RNA和DNA提取 使用RNease PowerSoil Total RNA kit进行样品总RNA的提取。 按试剂盒说明书进行操作提取微生物组的总RNA，共20个步骤。 漩涡震荡仪适配器 (Mo Bio, catalog number: 13000-V1-15) 实验步骤柑橘植株的选取 在柑橘果园内，观察柑橘植株的生长及健康状况
基于高通量测序的全长DNA条形码获取方法
Methods for Obtaining Full-length DNA Barcodes Using High-throughput Sequencing
Authors:  杨琛涛周程冉, 刘山林, 周欣 and date: 08/25/2021, view: 5284, Q&A: 0
... 实验操作及分析流程图动物全基因组DNA提取1.1简介 本流程采用利用玻璃纤维板DNA提取法 (Glass Fiber Plate method) 进行昆虫全基因组DNA的提取。 该方法是加拿大DNA条形码中心提供的批量提取DNA的方法，研究者可以根据自身项目需求采取不同的基因组DNA提取方法。 早期的生态及生物多样性研究经常利用Sanger测序方法来进行条形码测序，随着高通量测序技术 (High-Throughput Sequencing T