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微生物组的定量宏基因组学和定量宏转录组学方法
Quantitative Metagenomics and Metatranscriptomics Methods of Microbiome
Authors:  黄昕瑜张璐, 袁凌, 鞠峰 and date: 04/13/2021, view: 6177, Q&A: 1
XJ220A SCS）Nanodrop OneC（Thermo）涡旋混合器（杭州奥盛 MTV-1）实验步骤内标序列和PCR引物的设计与合成 本流程通过人工合成的DNA和RNA内标物投加来实现微生物群落的定量宏基因组学和定量宏转录组学分析 文库构建与测序 使用双端测序（2 x 150）的测序策略在Illumina的Hiseq4000平台上对构建的DNA和cDNA文库进行测序（实际测序策略和测序平台的选择并不局限于本文示例，可根据实际实验需求对
基于高通量测序的全长DNA条形码获取方法
Methods for Obtaining Full-length DNA Barcodes Using High-throughput Sequencing
Authors:  杨琛涛周程冉, 刘山林, 周欣 and date: 08/25/2021, view: 5255, Q&A: 0
早期的生态及生物多样性研究经常利用Sanger测序方法来进行条形码测序，随着高通量测序技术 (High-Throughput Sequencing Technologies，HTS) 的推广，DNA宏条形码和线粒体宏基因组方法也被越来越多的研究者接受并使用 人类基因组在最初构建时，大约花费了30亿美元，但随着高通量技术的发展，目前一个基因组的测序成本已经降低为不到600美元。 实验操作及分析流程图动物全基因组DNA提取1.1简介 本
野生动物微生物组数据平台构建的技术方法和实践挑战
Technical Frameworks and Practical Challenges in Developing Wildlife Microbiome Databases
Authors:  王恺毅杨蕊菁, 李雨霏, 赵李頔涵, 闫利平, 王海燕, 高云云 and date: 02/05/2026, view: 101, Q&A: 0
... 这些数据类型涵盖了扩增子测序、宏基因组测序、宏转录组、代谢组以及多组学整合数据，既包含基因序列、功能注释等基础信息，也反映了从个体到群落结构的多层次特征 [2]。 宏基因组、宏转录组、宏蛋白组、宏代谢组等不同层次的数据在同一平台上的融合，不仅可以更全面地解析微生物群落的结构与功能，还能为系统生物学和精准医学研究提供更丰富的参考 [43]。 国家微生物数据中心自2019年成立以来，整合了基因组、宏基因组、
Analysis of DNA 5-methylcytosine Using Nanopore Sequencing
使用纳米孔测序分析 DNA 5-甲基胞嘧啶
Authors:  Zhuowen LiLihao Zheng, Jixian Zhai, Yanping Long and date: 02/05/2024, view: 613, Q&A: 0
... 它广泛存在于基因组中，参与多种生物过程，调节基因表达和基因组稳定性。如今，纳米孔测序能够直接检测天然单分子长读长DNA上的DNA修饰，克服了短读长亚硫酸氢盐测序的局限性。 ... 莫伟鹏、张宏和于一鸣博士进行校对和评论。 用于牛津纳米孔测序的 DNA 甲基化调用工具：一项调查和人类表观基因组范围的评估。基因组生物学。
RNA病毒组与生物信息学分析
RNA Virome and Bioinformatics Analysis
Authors:  张誉译陈毅聪, 魏小曼, 崔杰 and date: 06/11/2021, view: 4990, Q&A: 0
... 人们不需要再颇费周章地寻找合适的病毒培养体系或模式动物，直接将感兴趣的样品构建成测序文库 (Library)，通过宏基因组 (Meta-genomics) 或宏转录组 (Meta-transcriptomics 2017年，ICTV宣布将通过宏基因组或宏转录组的方法发现的病毒加入正式的病毒学分类体系 (Simmonds et al., 2017)。 Zhang等人在他们的一篇评论中详细地介绍了利用宏基因组学、宏转录组学手段来拓展病毒圈 (Virosphere)，
培菌白蚁肠道簇虫分离与分子鉴定的方法
Isolation and Molecular Identification of Gregarine in the Gut of Fungus-growing Termite
Authors:  张硕林子佳, 倪金凤 and date: 06/17/2021, view: 3412, Q&A: 0
... 二、基因组DNA提取和SSU rDNA测序取簇虫样品50个左右，利用 微量样品基因组DNA提取试剂盒提取簇虫的基因组 DNA，用分光光度计检测DNA纯度，用琼脂糖电泳法检测DNA浓度。 将纯化后的SSU rDNA基因片段与pMD19-T载体连接，重组质粒送上海生工测序。三、系统发育分析测序结果在NCBI系统中进行Blast比对，下载相似性最高的相关序列。 (赛多利斯公司，北京，catalog number: ALC-110.4&1100.2)高压灭菌器 (申安医疗器械厂，