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鸟类鸣声：录音、回放和分析
Bird Song: Record, Playback and Analysis
Author:  夏灿玮date: 07/15/2021, view: 6336, Q&A: 0
... 当性状是无方向的随机演化时，谱系树上各相邻节点的差值之间是相互独立的。 含谱系关系的广义最小二乘法 (phylogenetic generalized least squares) 可以进一步放宽性状无方向随机演化的假定。 关于宏观性状演化的分析和结果的解读可参阅Garamszegi主编的书籍《Modern Phylogenetic Comparative Methods and Their Application in 比如Odom et al. (2014) 通过将雌鸟是否鸣
显微CT简介与应用：以鱼类为例
A Profile of X-ray Microtomography and its Application in Ichthyology
Author:  和友date: 07/23/2021, view: 3970, Q&A: 0
... 而基于分子和形态的系统发育关系的不一致性，促使人们重新考虑性状演化中的同源关系和趋同进化。 根据不同图像灰度值可提取复原骨骼、咽齿、脑等特定器官，并可在任意切面进行微米级虚拟连续切片，追踪观察特定解剖结构，这提供了更多新的内部特征；利用显微CT方法可辅助物种识别鉴定，开展基于内部形态的系统发育关系分析，性状演化研究 研究背景"物种起源与演化"是进化生物学的研究主线。 ，并为演化生物学中其它相关理论问题提供形态学素材。 结果显示，此前Hoese and Gill (
基于转录组数据和短序列测序的系统发育研究方法
Phylogenomics based on transcriptomics and short-read sequences
Authors:  蒙冠良周程冉, 刘山林, 周欣 and date: 09/10/2021, view: 10290, Q&A: 0
... 研究背景理解物种之间的系统发育关系是构建生物演化框架的关键，也是进一步开展生物性状演化、生物地理变迁、分子遗传机制等分支学科的重要前提。 利用外群物种，我们可以明确所构建出来的系统发育树的演化方向)，考虑所有获得良好鉴定结果的化石证据；(2) 总结相关基于化石的衍征 (apomorphy, 即后代继承自其最近共同祖先的、相对于其余类群所新获得的性状或性状状态 ，可用于鉴定某个类群是否是单系群(monophyly)；而如果除了后代及其最近共同祖先的其它类群也拥有该性状
"自然分类"—老概念，新诠释
Natural Classification, Old Concepts and New Interpretations
Author:  任东date: 05/11/2021, view: 5378, Q&A: 0
... 古今结合、宏观和微观结合，利用分子-形态-化石性状全证据，将化石类群和现生类群放在一颗演化树上重建生物的系统发育树和历史演化过程，是重构自然分类的必由之路！ 大量的演化生物学研究证实，仅用现代生物的分子数据无法恢复和重建祖先类群和已绝灭种类的形态性状和功能习性。 对于一个具有漫长演化发展历史的类群而言，由于绝灭类群的分子遗传数据无法获得，形态性状是沟通古今的唯一纽带。 只有形态性状分析能够解决早期生物类群的习性、行为生态和系统演化
使用BEAST 2开展贝叶斯支端定年分析
Using BEAST 2 for Bayesian Tip Dating
Authors:  罗阿蓉张驰, 朱朝东 and date: 07/15/2021, view: 6093, Q&A: 0
... 其虽然主要用于推断生物类群的历史分异时间，但也可以用于构建系统发生树、重建类群祖先性状、估计种群大小、实施模型选择等等 (Bouckaert et al., 2019)。 伴随分子数据的涌现、化石信息的积累、以及演化模型 (如分子钟) 的发展，贝叶斯定年法近些年得到了广泛关注和应用。 该模型假设演化速率服从独立的对数正态分布。2.7点击BEAUti主选项Priors开始先验设置。 形态数据部分由"0"或"1"代表化石和现生类群的离散性状特征 (图1，附件信息https://githu
鸟类羽色的测量与分析
Measurement and Analyses of Avian Plumage Color
Authors:  陈功李铮, 张雁云, 董路 and date: 10/28/2021, view: 2700, Q&A: 0
... 研究背景羽色是鸟类最重要的性状之一，对羽色及其多样性的形成机制的研究极大地推动了鸟类生态与演化等多方向的发展。 因此，在进行包含众多物种的鸟类系统演化等方向的研究时，更多通过鸟类图片（主要是彩绘图）来获取鸟类羽色数据 (Dale normal;">et al.,