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蝴蝶Hi-C文库构建
Construction of Hi-C Library for Butterfly
Authors:
万雯婷
常洲
,
董志巍
,
王文
,
李学燕
and
date:
09/16/2021,
view:
2317,
Q&A:
0
当
文库
浓度>5 μg/μl,体积>20 μl;
文库
片段大小集中在500-600 bp 即可将
文库
送测序公司进行上机测序。 3)qPCR法对
文库
的有效浓度进行精确定量 (测序公司对
文库
进行qPCR质控)。 Hi-C
文库
测序 (Hi-C Sequencing) 所获得的Hi-C
文库
使用Illumina HiseqXten (PE150) 平台进行上机测序,测序深度根据物种的基因组大小和项目的设计进行确定。 /异染色质 (A/B compartment)、拓扑相关
蝴蝶ATAC-seq文库构建
Construction of ATAC-seq Library for Butterfly
Authors:
万雯婷
常洲
,
董志巍
,
王文
,
李学燕
and
date:
08/25/2021,
view:
2373,
Q&A:
0
8)置于磁力架上静置5 min,收集上清液,即为ATAC-seq
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,可于-20 °C保待用。ATAC-seq
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质控1)使用Qubit dsDNA HS Assay kit对
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的浓度进行初步定量。 2)使用Agilent High Sensitivity DNA kit检测
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DNA片段的完整性及插入片段的大小。3)qPCR法对
文库
的有效浓度进行精确定量。 ATAC-seq
文库
测序 所获得的ATAC-seq
文库
使用Illumina HiseqXten (PE150)