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Identification of Accessible Chromatin Regions with MNase-seq
使用MNase-seq鉴定可及染色质区域
Authors:  Chuizheng KongHongcui Pei, Zefu Lu, Lifeng Gao, Guangyao Zhao, Xu Liu, Jizeng Jia and date: 03/20/2024, view: 671, Q&A: 0
... 摘要:可及染色质的研究也称为开放染色质,是目前染色质非编码顺式调控元件和基因表达顺反控制研究的热点。与动物相比,植物物种中可接近的染色质是不同的并且相对保守。 ... 染色质可及性:了解基因组的窗口。表观遗传学。染色质。7(1):33。 MNase 滴定揭示了核小体占用率和染色质可及性之间的差异。纳特。交流。7:11485。 Rodgers-Melnick,
水稻染色质免疫共沉淀
ChIP Assay in Rice
Authors:  翁小煜周少立, 宗伟, 欧阳亦聃 and date: 04/09/2018, view: 13280, Q&A: 6
不同超声时间下染色质的片段化范围3.2取10 μl超声波片段化之后的染色质裂解液和超声前的2 μl对照分别加入500 μl灭菌ddH2O和20 μl 5 M NaCl,65 °C水浴解交联过夜,剩下的染色质裂解液保存于 2.10离心好后用枪吸干上清,加入400 μl 2x Nuclear lysis buffer (见溶液配方4) 至染色质沉淀中,重新在核裂解液中悬浮染色质。 注:1) 此步骤中,得到的染色质沉淀应为白色或浅绿色,如果为深绿色,说明杂质较多,可以加入1 ml Extrac