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ChIP Assay for Cell Culture
对培养细胞的染色体免疫共沉淀分析
Author:  Ran Chendate: 01/20/2011, view: 18414, Q&A: 0
... 染色质免疫沉淀（ChIP）是用于确定特定目标蛋白质的基因组上的DNA结合位点的位置的方法。 交联后，裂解细胞，通过超声处理将DNA断裂成长度为0.2-1.0kb的片段。 ... 加入免疫沉淀抗体（每次抗体的量将不同）到2ml上清液部分中，并在4℃下旋转孵育2小时。
R-ChIP: 利用失活RNase H1来构建全基因组范围内 R-loop图谱的文库
R-ChIP: Genome-wide Mapping of R-loops by Using Inactive RNase H
Authors:  江翱张显红, 周宇, 陈加余, 陈亮 and date: 09/15/2022, view: 2197, Q&A: 0
... K562细胞超声30 min 片段大小分布在100-400 bp免疫共沉淀。步骤5得到的上清用Nanodrop A280测定蛋白浓度，并用TE buffer将不同样品的蛋白浓度调至一致。 基于以上问题，我们利用不同原理开发了新的基因组R-loop定位技术。 现阶段定位基因组中R-loop的方法主要是依赖S9.6抗体的DRIP-seq以及多种衍生技术 (Xu et al., 2017)。 冰浴10 min，混匀后放入超声波破碎仪中，高功率破碎25次，每次工作30 s/间歇30 s，每超声5次将样品拿出来吹打混匀，避免
产品说明书：KAPA独立双端标记接头试剂盒 Illumina®平台
Author:  罗氏诊断产品（上海）有限公司生命科学部date: 08/15/2019, view: 9009, Q&A: 0
... 人类全基因组测序，特别是无PCR扩增的工作流程 ● 使用SeqCap EZ HyperCap工作流程或其他杂交捕获系统（与兼容的Blocker结合使用）进行全外显子组或靶向测序 ● RNA测序 ● 染色质免疫共沉淀测序 ● 请遵循技术数据表中针对您的KAPA文库制备试剂盒的连接后纯化指导说明。 ● 获取专为计算接头：插入片段摩尔比和原液浓度而设计的计算器，请访问www.sequencing.roche.com/support联系技术支持。 当从不同起始量和片段长度构建文库时，请参阅特定KAPA文
产品说明书：KAPA DNA HyperPrep文库构建
Author:  罗氏诊断产品（上海）有限公司生命科学部date: 08/15/2019, view: 4279, Q&A: 0
... 鸟枪法测序 ● 全外显子或靶向测序，使用Roche SeqCap EZ、Agilent SureSelect、Illumina TruSeq或IDT xGen Lockdown探针，或其他杂交捕获系统 ● 染色质免疫共沉淀测序 文库扩增 注意：请参阅重要参数：文库扩增（原说明书第6-7页）和KAPA